基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2011年
4期
371-378
,共8页
毛源泽%韦芳萍%王俊美%刘强
毛源澤%韋芳萍%王俊美%劉彊
모원택%위방평%왕준미%류강
tRNA序列%cvTree方法%复杂网络
tRNA序列%cvTree方法%複雜網絡
tRNA서렬%cvTree방법%복잡망락
本文利用cvTree和复杂网络理论相结合的方法,构建了3 420条tRNA序列亲缘关系进化网络.计算了相关网络的平均度、平均聚类系数和平均最短路径随进化距离Dis变化的关系.同时还分析和讨论了tRNA序列之间的亲缘关系及其进化机制,观察到一个与其它方法不同的结果:随着亲缘距离Dis的增加,网络的度分布先是从power-law分布转变为Gussian分布,然后又从Gussian分布转变为反power-law分布.本研究结果说明由cvTree方法和复杂网络理论相结合的方法研究tRNA基因序列的进化的结果也许更加符合其进化历程.
本文利用cvTree和複雜網絡理論相結閤的方法,構建瞭3 420條tRNA序列親緣關繫進化網絡.計算瞭相關網絡的平均度、平均聚類繫數和平均最短路徑隨進化距離Dis變化的關繫.同時還分析和討論瞭tRNA序列之間的親緣關繫及其進化機製,觀察到一箇與其它方法不同的結果:隨著親緣距離Dis的增加,網絡的度分佈先是從power-law分佈轉變為Gussian分佈,然後又從Gussian分佈轉變為反power-law分佈.本研究結果說明由cvTree方法和複雜網絡理論相結閤的方法研究tRNA基因序列的進化的結果也許更加符閤其進化歷程.
본문이용cvTree화복잡망락이론상결합적방법,구건료3 420조tRNA서렬친연관계진화망락.계산료상관망락적평균도、평균취류계수화평균최단로경수진화거리Dis변화적관계.동시환분석화토론료tRNA서렬지간적친연관계급기진화궤제,관찰도일개여기타방법불동적결과:수착친연거리Dis적증가,망락적도분포선시종power-law분포전변위Gussian분포,연후우종Gussian분포전변위반power-law분포.본연구결과설명유cvTree방법화복잡망락이론상결합적방법연구tRNA기인서렬적진화적결과야허경가부합기진화역정.
