林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2008年
10期
55-62
,共8页
胡孝义%谭晓风%张党权%曾艳铃%陈鸿鹏%田晓明%刘巧
鬍孝義%譚曉風%張黨權%曾豔鈴%陳鴻鵬%田曉明%劉巧
호효의%담효풍%장당권%증염령%진홍붕%전효명%류교
油茶%脱水素基因%cDNA文库%RACE%生理功能%生物信息学
油茶%脫水素基因%cDNA文庫%RACE%生理功能%生物信息學
유다%탈수소기인%cDNA문고%RACE%생리공능%생물신식학
以构建的油茶EST文库为基础,采用电子克隆技术,分离克隆一个脱水素基因的全长cDNA序列,该基因的cDNA全长1 406 bp,含一个600 bp的CDS,编码200明的小分子蛋白.推测该基因编码蛋白的分子质量为21 ku,等电点7,暂命名为CoDHNI.同源性分析发现该基因的编码蛋白具有2个Y-片段(DEYGNP),1个S-片段(SGSSSSSS),2个K-片段(KIKEKLPG),属于典型的Y2sIQ型脱水素.经Blast比对,发现富含苏氨酸的Thr-区在各物种间变异显著,推测该区为油茶所特有,有利于在被保护的大分子表面形成水合层;同时还发现一个十分保守的基序:EDDGQGGRRKK,可能有利于脱水素的磷酸化和亚细胞定位.通过与柑桔和拟南芥的脱水素比较,提出CoDHNI有可能缓冲种子脱水胁迫响应时钙离子的瞬时增高,并可结合重金属离子,以减轻活性氧的危害.
以構建的油茶EST文庫為基礎,採用電子剋隆技術,分離剋隆一箇脫水素基因的全長cDNA序列,該基因的cDNA全長1 406 bp,含一箇600 bp的CDS,編碼200明的小分子蛋白.推測該基因編碼蛋白的分子質量為21 ku,等電點7,暫命名為CoDHNI.同源性分析髮現該基因的編碼蛋白具有2箇Y-片段(DEYGNP),1箇S-片段(SGSSSSSS),2箇K-片段(KIKEKLPG),屬于典型的Y2sIQ型脫水素.經Blast比對,髮現富含囌氨痠的Thr-區在各物種間變異顯著,推測該區為油茶所特有,有利于在被保護的大分子錶麵形成水閤層;同時還髮現一箇十分保守的基序:EDDGQGGRRKK,可能有利于脫水素的燐痠化和亞細胞定位.通過與柑桔和擬南芥的脫水素比較,提齣CoDHNI有可能緩遲種子脫水脅迫響應時鈣離子的瞬時增高,併可結閤重金屬離子,以減輕活性氧的危害.
이구건적유다EST문고위기출,채용전자극륭기술,분리극륭일개탈수소기인적전장cDNA서렬,해기인적cDNA전장1 406 bp,함일개600 bp적CDS,편마200명적소분자단백.추측해기인편마단백적분자질량위21 ku,등전점7,잠명명위CoDHNI.동원성분석발현해기인적편마단백구유2개Y-편단(DEYGNP),1개S-편단(SGSSSSSS),2개K-편단(KIKEKLPG),속우전형적Y2sIQ형탈수소.경Blast비대,발현부함소안산적Thr-구재각물충간변이현저,추측해구위유다소특유,유리우재피보호적대분자표면형성수합층;동시환발현일개십분보수적기서:EDDGQGGRRKK,가능유리우탈수소적린산화화아세포정위.통과여감길화의남개적탈수소비교,제출CoDHNI유가능완충충자탈수협박향응시개리자적순시증고,병가결합중금속리자,이감경활성양적위해.
