遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2005年
2期
173-180
,共8页
中国猪种%SLA-DQB%遗传多样性
中國豬種%SLA-DQB%遺傳多樣性
중국저충%SLA-DQB%유전다양성
运用PCR-SSCP和克隆测序对中国部分猪种的SLA-DQB基因外显子2的多态性分析表明:有功能的DQB基因有68个新等位基因,假基因(SLA-DXB)等位基因有5个.各等位基因的数量分布极其不平衡,而且许多品种都表现出共享等位基因.9个主要等位基因中,C08广泛分布在中国猪种的6大地方类型11个品种及云南和四川野猪中,它为中国猪种特有的共享等位基因,占总数的55.10%.在单一的个体中拥有5条以上序列,说明SLA-DQB基因座在某些品种中拷贝数为3个.SLA-DQB外显子2的等位基因核苷酸和氨基酸多态变异位点分别高达81个和49个,等位基因多样度(H=0.889)以及核苷酸多样度(Pi=0.047)都很高,总体表现为β折叠区的Pi值均高于α螺旋区.综合分析表明华南型、西南型猪H和Pi均较高,高原型的藏猪最低.类群内遗传距离排序与Pi值高低排序一样,可见各地方类型中核苷酸替换的差异正比于核苷酸多样度.类群间遗传距离比较,江海型与华北型间的距离最大,而华中型和高原型间的遗传距离最小.
運用PCR-SSCP和剋隆測序對中國部分豬種的SLA-DQB基因外顯子2的多態性分析錶明:有功能的DQB基因有68箇新等位基因,假基因(SLA-DXB)等位基因有5箇.各等位基因的數量分佈極其不平衡,而且許多品種都錶現齣共享等位基因.9箇主要等位基因中,C08廣汎分佈在中國豬種的6大地方類型11箇品種及雲南和四川野豬中,它為中國豬種特有的共享等位基因,佔總數的55.10%.在單一的箇體中擁有5條以上序列,說明SLA-DQB基因座在某些品種中拷貝數為3箇.SLA-DQB外顯子2的等位基因覈苷痠和氨基痠多態變異位點分彆高達81箇和49箇,等位基因多樣度(H=0.889)以及覈苷痠多樣度(Pi=0.047)都很高,總體錶現為β摺疊區的Pi值均高于α螺鏇區.綜閤分析錶明華南型、西南型豬H和Pi均較高,高原型的藏豬最低.類群內遺傳距離排序與Pi值高低排序一樣,可見各地方類型中覈苷痠替換的差異正比于覈苷痠多樣度.類群間遺傳距離比較,江海型與華北型間的距離最大,而華中型和高原型間的遺傳距離最小.
운용PCR-SSCP화극륭측서대중국부분저충적SLA-DQB기인외현자2적다태성분석표명:유공능적DQB기인유68개신등위기인,가기인(SLA-DXB)등위기인유5개.각등위기인적수량분포겁기불평형,이차허다품충도표현출공향등위기인.9개주요등위기인중,C08엄범분포재중국저충적6대지방류형11개품충급운남화사천야저중,타위중국저충특유적공향등위기인,점총수적55.10%.재단일적개체중옹유5조이상서렬,설명SLA-DQB기인좌재모사품충중고패수위3개.SLA-DQB외현자2적등위기인핵감산화안기산다태변이위점분별고체81개화49개,등위기인다양도(H=0.889)이급핵감산다양도(Pi=0.047)도흔고,총체표현위β절첩구적Pi치균고우α라선구.종합분석표명화남형、서남형저H화Pi균교고,고원형적장저최저.류군내유전거리배서여Pi치고저배서일양,가견각지방류형중핵감산체환적차이정비우핵감산다양도.류군간유전거리비교,강해형여화북형간적거리최대,이화중형화고원형간적유전거리최소.
