蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2011年
2期
266-271
,共6页
李京生%杨瑞生%贾萍%石生林%刘彦群%潘敏慧%秦利
李京生%楊瑞生%賈萍%石生林%劉彥群%潘敏慧%秦利
리경생%양서생%가평%석생림%류언군%반민혜%진리
柞蚕核型多角体病毒%家蚕核型多角体病毒%同义密码子%密码子偏好性
柞蠶覈型多角體病毒%傢蠶覈型多角體病毒%同義密碼子%密碼子偏好性
작잠핵형다각체병독%가잠핵형다각체병독%동의밀마자%밀마자편호성
基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染.通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNPV同义密码子使用模式差异.ApNPV和BmNPV的密码子偏好性均较弱,但二者的ENc值和GC含量差异显著;除碱基组成外,还存在其它因素影响密码子使用模式,但各影响因素的贡献率均较低,在基于密码子使用频率的对应分析中BmNPV的第1、第2向量轴贡献率均低于ApNPV;ApNPV的基因表达水平与GC含量、GC3s含量以及ENc值极显著相关(r分别为0.418、0.735、-0.628,P=0.000),而BmNPV的基因表达水平只与GC3s含量呈弱相关(r=0.214,P=0.010).分析结果显示,ApNPV和BmNPV的密码子偏好性虽均较弱,但同义密码使用模式及其影响因素存在差异.
基因組中的基因和基因密碼子組成不同使柞蠶覈型多角體病毒(ApNPV)與傢蠶覈型多角體病毒(BmNPV)間不能交扠感染.通過計算有效密碼子數(ENc)、相對同義密碼子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密碼子適應指數(CAI),比較分析ApNPV和BmNPV同義密碼子使用模式差異.ApNPV和BmNPV的密碼子偏好性均較弱,但二者的ENc值和GC含量差異顯著;除堿基組成外,還存在其它因素影響密碼子使用模式,但各影響因素的貢獻率均較低,在基于密碼子使用頻率的對應分析中BmNPV的第1、第2嚮量軸貢獻率均低于ApNPV;ApNPV的基因錶達水平與GC含量、GC3s含量以及ENc值極顯著相關(r分彆為0.418、0.735、-0.628,P=0.000),而BmNPV的基因錶達水平隻與GC3s含量呈弱相關(r=0.214,P=0.010).分析結果顯示,ApNPV和BmNPV的密碼子偏好性雖均較弱,但同義密碼使用模式及其影響因素存在差異.
기인조중적기인화기인밀마자조성불동사작잠핵형다각체병독(ApNPV)여가잠핵형다각체병독(BmNPV)간불능교차감염.통과계산유효밀마자수(ENc)、상대동의밀마자사용도(RSCU)、GC함량、GC3s함량、밀마자괄응지수(CAI),비교분석ApNPV화BmNPV동의밀마자사용모식차이.ApNPV화BmNPV적밀마자편호성균교약,단이자적ENc치화GC함량차이현저;제감기조성외,환존재기타인소영향밀마자사용모식,단각영향인소적공헌솔균교저,재기우밀마자사용빈솔적대응분석중BmNPV적제1、제2향량축공헌솔균저우ApNPV;ApNPV적기인표체수평여GC함량、GC3s함량이급ENc치겁현저상관(r분별위0.418、0.735、-0.628,P=0.000),이BmNPV적기인표체수평지여GC3s함량정약상관(r=0.214,P=0.010).분석결과현시,ApNPV화BmNPV적밀마자편호성수균교약,단동의밀마사용모식급기영향인소존재차이.
