计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2012年
6期
126-128
,共3页
蛋白质亚细胞定位%多标记学习%Gene Ontology%最近邻算法
蛋白質亞細胞定位%多標記學習%Gene Ontology%最近鄰算法
단백질아세포정위%다표기학습%Gene Ontology%최근린산법
蛋白质亚细胞定位是蛋白质组学基本问题之一.某些类型蛋白质可能存在于两个或两个以上的亚细胞位置,这类蛋白质的亚细胞定位问题更为复杂.分别利用Gene Ontology和伪氨基酸成分法,将一条蛋白质表示为一实值向量;采纳多标记学习中的Ranking思想,计算出一得分向量V,该向量的每一分量的值表示被预测蛋白质属于某个亚细胞位置的概率;利用最近邻算法预测蛋白质所属亚细胞位置的个数n,得分向量V中得分最高的n个分量对应的亚细胞位置即为预测的位置.
蛋白質亞細胞定位是蛋白質組學基本問題之一.某些類型蛋白質可能存在于兩箇或兩箇以上的亞細胞位置,這類蛋白質的亞細胞定位問題更為複雜.分彆利用Gene Ontology和偽氨基痠成分法,將一條蛋白質錶示為一實值嚮量;採納多標記學習中的Ranking思想,計算齣一得分嚮量V,該嚮量的每一分量的值錶示被預測蛋白質屬于某箇亞細胞位置的概率;利用最近鄰算法預測蛋白質所屬亞細胞位置的箇數n,得分嚮量V中得分最高的n箇分量對應的亞細胞位置即為預測的位置.
단백질아세포정위시단백질조학기본문제지일.모사류형단백질가능존재우량개혹량개이상적아세포위치,저류단백질적아세포정위문제경위복잡.분별이용Gene Ontology화위안기산성분법,장일조단백질표시위일실치향량;채납다표기학습중적Ranking사상,계산출일득분향량V,해향량적매일분량적치표시피예측단백질속우모개아세포위치적개솔;이용최근린산법예측단백질소속아세포위치적개수n,득분향량V중득분최고적n개분량대응적아세포위치즉위예측적위치.