生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2010年
8期
199-203
,共5页
草鱼%CYP1A%β-肌动蛋白%cDNA%克隆
草魚%CYP1A%β-肌動蛋白%cDNA%剋隆
초어%CYP1A%β-기동단백%cDNA%극륭
以Trizol法分别提取BNF诱导和对照处理草鱼的肝组织总RNA并合成cDNA第一链,以此为模板利用1对ACT特异性引物和(8条)6对CYP1A简并引物进行扩增.结果显示,引物对F0-R0在对照和诱导草鱼中均扩增得到预期ACT cDNA片段,而引物对F4-R4在诱导草鱼中获得预期CYP1A cDNA产物.这两个cDNA片段分别进行克隆、测序和比对,BLAST结果表明草鱼ACT cDNA片段(800 bp)与GenBank中ACT基因(登录号M25013)同源性为99.1%,推导氨基酸序列同源性为99.2%;草鱼CYP1A cDNA片段(439 bp)与鲤鱼同源性最高,为92.5%,推导氨基酸同源性为96.6%.上述序列提交GenBank,获得登录号分别为DQ211096和DQ211095.通过Mega 3.1软件的Neighbor-joining程序对CYP基因的部分cDNA序列和氨基酸序列进行比对分析并绘制进化树,根据CYP1A部分蛋白的系统发育关系,在进化上可以将参与比对的真骨鱼划分为4个主要的分支.
以Trizol法分彆提取BNF誘導和對照處理草魚的肝組織總RNA併閤成cDNA第一鏈,以此為模闆利用1對ACT特異性引物和(8條)6對CYP1A簡併引物進行擴增.結果顯示,引物對F0-R0在對照和誘導草魚中均擴增得到預期ACT cDNA片段,而引物對F4-R4在誘導草魚中穫得預期CYP1A cDNA產物.這兩箇cDNA片段分彆進行剋隆、測序和比對,BLAST結果錶明草魚ACT cDNA片段(800 bp)與GenBank中ACT基因(登錄號M25013)同源性為99.1%,推導氨基痠序列同源性為99.2%;草魚CYP1A cDNA片段(439 bp)與鯉魚同源性最高,為92.5%,推導氨基痠同源性為96.6%.上述序列提交GenBank,穫得登錄號分彆為DQ211096和DQ211095.通過Mega 3.1軟件的Neighbor-joining程序對CYP基因的部分cDNA序列和氨基痠序列進行比對分析併繪製進化樹,根據CYP1A部分蛋白的繫統髮育關繫,在進化上可以將參與比對的真骨魚劃分為4箇主要的分支.
이Trizol법분별제취BNF유도화대조처리초어적간조직총RNA병합성cDNA제일련,이차위모판이용1대ACT특이성인물화(8조)6대CYP1A간병인물진행확증.결과현시,인물대F0-R0재대조화유도초어중균확증득도예기ACT cDNA편단,이인물대F4-R4재유도초어중획득예기CYP1A cDNA산물.저량개cDNA편단분별진행극륭、측서화비대,BLAST결과표명초어ACT cDNA편단(800 bp)여GenBank중ACT기인(등록호M25013)동원성위99.1%,추도안기산서렬동원성위99.2%;초어CYP1A cDNA편단(439 bp)여리어동원성최고,위92.5%,추도안기산동원성위96.6%.상술서렬제교GenBank,획득등록호분별위DQ211096화DQ211095.통과Mega 3.1연건적Neighbor-joining정서대CYP기인적부분cDNA서렬화안기산서렬진행비대분석병회제진화수,근거CYP1A부분단백적계통발육관계,재진화상가이장삼여비대적진골어화분위4개주요적분지.