海洋科学进展
海洋科學進展
해양과학진전
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY OF HUANGHAI & BOHAI SEAS
2008年
2期
207-213
,共7页
韩光%丛柏林%黄晓航%刘胜浩%刘晨临%林学政
韓光%叢柏林%黃曉航%劉勝浩%劉晨臨%林學政
한광%총백림%황효항%류성호%류신림%림학정
钙激活%钾离子通道%大菱鲆%基因克隆
鈣激活%鉀離子通道%大蔆鲆%基因剋隆
개격활%갑리자통도%대릉평%기인극륭
钙激活型钾离子通道蛋白(KCa)是位于细胞膜表面调节细胞功能的一类膜蛋白.通过设计特异性引物,以我国海水养殖大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)血液cDNA为模板,利用RT-PCR 技术克隆获得了一条基因片段.生物信息学分析证实该片段来自钙激活型钾离子通道基因SKCa (小电导钙激活型钾通道)家族.设计巢式PCR引物,通过5′RACE和3′RACE分别克隆得到了该基因的5′端序列和3′端序列.使用生物学软件拼接3段序列得到了大菱鲆钙激活型钾离子通道TSKCa基因的全长序列.TSKCa基因cDNA全长为1 698 bp,其中开放阅读框长度为1 632 bp,编码的TSKCa蛋白有544个氨基酸.比对TSKCa蛋白与GenBank中已有的SKCa蛋白序列,证实其序列同源性很高.使用网络DAS和srsbin服务器对TSKCa蛋白进行跨膜结构预测和疏水性分析,并结合已有的研究结果推测TSKCa蛋白的结构由S1～S6六个跨膜结构域和一个孔道区(P区)组成.
鈣激活型鉀離子通道蛋白(KCa)是位于細胞膜錶麵調節細胞功能的一類膜蛋白.通過設計特異性引物,以我國海水養殖大蔆鲆(Scophthalmus maximus L.)血液cDNA為模闆,利用RT-PCR 技術剋隆穫得瞭一條基因片段.生物信息學分析證實該片段來自鈣激活型鉀離子通道基因SKCa (小電導鈣激活型鉀通道)傢族.設計巢式PCR引物,通過5′RACE和3′RACE分彆剋隆得到瞭該基因的5′耑序列和3′耑序列.使用生物學軟件拼接3段序列得到瞭大蔆鲆鈣激活型鉀離子通道TSKCa基因的全長序列.TSKCa基因cDNA全長為1 698 bp,其中開放閱讀框長度為1 632 bp,編碼的TSKCa蛋白有544箇氨基痠.比對TSKCa蛋白與GenBank中已有的SKCa蛋白序列,證實其序列同源性很高.使用網絡DAS和srsbin服務器對TSKCa蛋白進行跨膜結構預測和疏水性分析,併結閤已有的研究結果推測TSKCa蛋白的結構由S1～S6六箇跨膜結構域和一箇孔道區(P區)組成.
개격활형갑리자통도단백(KCa)시위우세포막표면조절세포공능적일류막단백.통과설계특이성인물,이아국해수양식대릉평(Scophthalmus maximus L.)혈액cDNA위모판,이용RT-PCR 기술극륭획득료일조기인편단.생물신식학분석증실해편단래자개격활형갑리자통도기인SKCa (소전도개격활형갑통도)가족.설계소식PCR인물,통과5′RACE화3′RACE분별극륭득도료해기인적5′단서렬화3′단서렬.사용생물학연건병접3단서렬득도료대릉평개격활형갑리자통도TSKCa기인적전장서렬.TSKCa기인cDNA전장위1 698 bp,기중개방열독광장도위1 632 bp,편마적TSKCa단백유544개안기산.비대TSKCa단백여GenBank중이유적SKCa단백서렬,증실기서렬동원성흔고.사용망락DAS화srsbin복무기대TSKCa단백진행과막결구예측화소수성분석,병결합이유적연구결과추측TSKCa단백적결구유S1～S6륙개과막결구역화일개공도구(P구)조성.
