生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2011年
1期
20-23
,共4页
周成贵%姚晨%李红东%郭政
週成貴%姚晨%李紅東%郭政
주성귀%요신%리홍동%곽정
枢纽蛋白%共表达%相关%前列腺癌%转移
樞紐蛋白%共錶達%相關%前列腺癌%轉移
추뉴단백%공표체%상관%전렬선암%전이
通过枢纽蛋白与其互作邻居之间的共表达关系在从前列腺正常组织到原位癌及原位癌到转移的两个发展阶段的变化,寻找在前列腺癌发生和发展过程中动态改变的枢纽蛋白,为探讨前列腺癌的发病与转移机理提供线索.基于前列腺正常组织、原位癌与癌转移后组织的基因表达谱数据,在前列腺癌的两个发展阶段分别检测到1 578和2 347个动态改变的枢纽蛋白.平均超过95%的在一个发展阶段动态改变的枢纽蛋白与在另一发展阶段动态改变的枢纽蛋白中的至少一个蛋白共享显著多的互作邻居.另外,两组动态改变的枢纽蛋白中有780个交叠蛋白,其中大约50%的蛋白与其互作邻居之间的共表达关系在两个发展阶段的强弱变化方向相反.结果提示,在前列腺癌的发生和发展过程中,动态改变的枢纽蛋白影响的功能通路高度一致,但是它们与其互作邻居之间有着不同的共表达模式.
通過樞紐蛋白與其互作鄰居之間的共錶達關繫在從前列腺正常組織到原位癌及原位癌到轉移的兩箇髮展階段的變化,尋找在前列腺癌髮生和髮展過程中動態改變的樞紐蛋白,為探討前列腺癌的髮病與轉移機理提供線索.基于前列腺正常組織、原位癌與癌轉移後組織的基因錶達譜數據,在前列腺癌的兩箇髮展階段分彆檢測到1 578和2 347箇動態改變的樞紐蛋白.平均超過95%的在一箇髮展階段動態改變的樞紐蛋白與在另一髮展階段動態改變的樞紐蛋白中的至少一箇蛋白共享顯著多的互作鄰居.另外,兩組動態改變的樞紐蛋白中有780箇交疊蛋白,其中大約50%的蛋白與其互作鄰居之間的共錶達關繫在兩箇髮展階段的彊弱變化方嚮相反.結果提示,在前列腺癌的髮生和髮展過程中,動態改變的樞紐蛋白影響的功能通路高度一緻,但是它們與其互作鄰居之間有著不同的共錶達模式.
통과추뉴단백여기호작린거지간적공표체관계재종전렬선정상조직도원위암급원위암도전이적량개발전계단적변화,심조재전렬선암발생화발전과정중동태개변적추뉴단백,위탐토전렬선암적발병여전이궤리제공선색.기우전렬선정상조직、원위암여암전이후조직적기인표체보수거,재전렬선암적량개발전계단분별검측도1 578화2 347개동태개변적추뉴단백.평균초과95%적재일개발전계단동태개변적추뉴단백여재령일발전계단동태개변적추뉴단백중적지소일개단백공향현저다적호작린거.령외,량조동태개변적추뉴단백중유780개교첩단백,기중대약50%적단백여기호작린거지간적공표체관계재량개발전계단적강약변화방향상반.결과제시,재전렬선암적발생화발전과정중,동태개변적추뉴단백영향적공능통로고도일치,단시타문여기호작린거지간유착불동적공표체모식.
