生物技术通讯
生物技術通訊
생물기술통신
LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
2006年
4期
520-525
,共6页
高英堂%杜智%王毅军%阚学锋%朱争艳%景丽%聂福华
高英堂%杜智%王毅軍%闞學鋒%硃爭豔%景麗%聶福華
고영당%두지%왕의군%감학봉%주쟁염%경려%섭복화
肝细胞癌%抑制性消减杂交%cDNA文库%生物信息学
肝細胞癌%抑製性消減雜交%cDNA文庫%生物信息學
간세포암%억제성소감잡교%cDNA문고%생물신식학
目的:构建肝细胞癌的高表达基因cDNA文库并进行相应的生物信息学分析.方法:应用抑制性消减杂交(SSH)技术,以7对肝癌组织和癌旁组织为实验材料,构建肝癌高表达基因的cDNA文库;使用BioEdit、BLAST和EGAD等软件进行生物信息学分析.结果:获得1 450个白色阳性克隆,经PCR扩增后均有100～1 000 bb的插入片段,经杂交验证选取125个克隆进行测序;经BLAST、EGAD等生物信息学工具分析获得基因83个,其中细胞分裂相关基因5个,参与细胞信号转导或通讯的基因5个,参与细胞结构或运动的基因7个,细胞或器官防御相关基因11个,参与细胞内基因转录或蛋白表达的基因22个,代谢相关基因18个,另有15个未归类基因.结论:利用SSH技术可构建肝细胞癌组织差异表达基因的消减cDNA文库,为进一步深入探讨肝癌的诊断、治疗和预后评估等提供更多的分子指标.
目的:構建肝細胞癌的高錶達基因cDNA文庫併進行相應的生物信息學分析.方法:應用抑製性消減雜交(SSH)技術,以7對肝癌組織和癌徬組織為實驗材料,構建肝癌高錶達基因的cDNA文庫;使用BioEdit、BLAST和EGAD等軟件進行生物信息學分析.結果:穫得1 450箇白色暘性剋隆,經PCR擴增後均有100～1 000 bb的插入片段,經雜交驗證選取125箇剋隆進行測序;經BLAST、EGAD等生物信息學工具分析穫得基因83箇,其中細胞分裂相關基因5箇,參與細胞信號轉導或通訊的基因5箇,參與細胞結構或運動的基因7箇,細胞或器官防禦相關基因11箇,參與細胞內基因轉錄或蛋白錶達的基因22箇,代謝相關基因18箇,另有15箇未歸類基因.結論:利用SSH技術可構建肝細胞癌組織差異錶達基因的消減cDNA文庫,為進一步深入探討肝癌的診斷、治療和預後評估等提供更多的分子指標.
목적:구건간세포암적고표체기인cDNA문고병진행상응적생물신식학분석.방법:응용억제성소감잡교(SSH)기술,이7대간암조직화암방조직위실험재료,구건간암고표체기인적cDNA문고;사용BioEdit、BLAST화EGAD등연건진행생물신식학분석.결과:획득1 450개백색양성극륭,경PCR확증후균유100～1 000 bb적삽입편단,경잡교험증선취125개극륭진행측서;경BLAST、EGAD등생물신식학공구분석획득기인83개,기중세포분렬상관기인5개,삼여세포신호전도혹통신적기인5개,삼여세포결구혹운동적기인7개,세포혹기관방어상관기인11개,삼여세포내기인전록혹단백표체적기인22개,대사상관기인18개,령유15개미귀류기인.결론:이용SSH기술가구건간세포암조직차이표체기인적소감cDNA문고,위진일보심입탐토간암적진단、치료화예후평고등제공경다적분자지표.
