广东海洋大学学报
廣東海洋大學學報
엄동해양대학학보
JOURNAL OF GUANGDONG OCEAN UNIVERSITY
2011年
1期
1-6
,共6页
闫秀英%吴灶和%简纪常%鲁义善%孙修勤
閆秀英%吳竈和%簡紀常%魯義善%孫脩勤
염수영%오조화%간기상%로의선%손수근
淋巴囊肿病毒中国分离株LCDV-cn%比较基因组学%生物信息学
淋巴囊腫病毒中國分離株LCDV-cn%比較基因組學%生物信息學
림파낭종병독중국분리주LCDV-cn%비교기인조학%생물신식학
LCDV-cn是分离自中国养殖牙鲆的淋巴囊肿病病原,给中国牙鲆养殖业带来了严重危害.通过PCR、克隆和测序,获得了LCDV-cn部分基因的序列,证明LCDV-cn与LCDV-C的基因组序列是一致的.比较基因组学分析发现,LCDV-cn基因组中有137个ORF是其独有的、与LCDV-1及其它虹彩病毒无同源区域.对LCDV-cn基因组进行生物信息学分析发现,在LCDV-cn独有的ORF中,有的编码与宿主同源的蛋白,有的编码与DNA复制相关的蛋白,某些ORF编码的蛋白含有跨膜区等.LCDV-cn的独有基因或许对其毒力和宿主范围有关.
LCDV-cn是分離自中國養殖牙鲆的淋巴囊腫病病原,給中國牙鲆養殖業帶來瞭嚴重危害.通過PCR、剋隆和測序,穫得瞭LCDV-cn部分基因的序列,證明LCDV-cn與LCDV-C的基因組序列是一緻的.比較基因組學分析髮現,LCDV-cn基因組中有137箇ORF是其獨有的、與LCDV-1及其它虹綵病毒無同源區域.對LCDV-cn基因組進行生物信息學分析髮現,在LCDV-cn獨有的ORF中,有的編碼與宿主同源的蛋白,有的編碼與DNA複製相關的蛋白,某些ORF編碼的蛋白含有跨膜區等.LCDV-cn的獨有基因或許對其毒力和宿主範圍有關.
LCDV-cn시분리자중국양식아평적림파낭종병병원,급중국아평양식업대래료엄중위해.통과PCR、극륭화측서,획득료LCDV-cn부분기인적서렬,증명LCDV-cn여LCDV-C적기인조서렬시일치적.비교기인조학분석발현,LCDV-cn기인조중유137개ORF시기독유적、여LCDV-1급기타홍채병독무동원구역.대LCDV-cn기인조진행생물신식학분석발현,재LCDV-cn독유적ORF중,유적편마여숙주동원적단백,유적편마여DNA복제상관적단백,모사ORF편마적단백함유과막구등.LCDV-cn적독유기인혹허대기독력화숙주범위유관.
