生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2011年
1期
1-5
,共5页
周建红%艾观华%方慧生%陈凯先
週建紅%艾觀華%方慧生%陳凱先
주건홍%애관화%방혜생%진개선
从头预测%能量函数%构象搜索%Rosetta
從頭預測%能量函數%構象搜索%Rosetta
종두예측%능량함수%구상수색%Rosetta
蛋白质结构从头预测是不依赖模板仅从氨基酸序列信息得到天然结构.它的关键是正确定义能量函数、精确选用计算机搜索算法来寻找能量最低值.基于此,本文系统介绍了能量函数和构象搜索策略,并列举了几种比较成功的从头预测方法,通过比较得出结论:基于统计学知识的能量函数是近年来从头预测发展的主要方向,现有从头预测的构象搜索都用到Monte Carlo法.这表明随着蛋白质结构预测研究的深入,能量函数的构建、构象搜索方法的选择、大分子蛋白质结构的从头预测等关键性问题都取得了突破性进展.
蛋白質結構從頭預測是不依賴模闆僅從氨基痠序列信息得到天然結構.它的關鍵是正確定義能量函數、精確選用計算機搜索算法來尋找能量最低值.基于此,本文繫統介紹瞭能量函數和構象搜索策略,併列舉瞭幾種比較成功的從頭預測方法,通過比較得齣結論:基于統計學知識的能量函數是近年來從頭預測髮展的主要方嚮,現有從頭預測的構象搜索都用到Monte Carlo法.這錶明隨著蛋白質結構預測研究的深入,能量函數的構建、構象搜索方法的選擇、大分子蛋白質結構的從頭預測等關鍵性問題都取得瞭突破性進展.
단백질결구종두예측시불의뢰모판부종안기산서렬신식득도천연결구.타적관건시정학정의능량함수、정학선용계산궤수색산법래심조능량최저치.기우차,본문계통개소료능량함수화구상수색책략,병열거료궤충비교성공적종두예측방법,통과비교득출결론:기우통계학지식적능량함수시근년래종두예측발전적주요방향,현유종두예측적구상수색도용도Monte Carlo법.저표명수착단백질결구예측연구적심입,능량함수적구건、구상수색방법적선택、대분자단백질결구적종두예측등관건성문제도취득료돌파성진전.
