生态科学
生態科學
생태과학
ECOLOGIC SCIENCE
2009年
1期
49-55
,共7页
莫旭华%史荣久%李慧%郑佳%王元芬%徐慧
莫旭華%史榮久%李慧%鄭佳%王元芬%徐慧
막욱화%사영구%리혜%정가%왕원분%서혜
amoA 克隆文库%RFLP 分析%氨氧化细菌(AOB)%氨氧化古菌(AOA)
amoA 剋隆文庫%RFLP 分析%氨氧化細菌(AOB)%氨氧化古菌(AOA)
amoA 극륭문고%RFLP 분석%안양화세균(AOB)%안양화고균(AOA)
通过构建氨氧化细菌(AOB )和氨氧化古菌(AOA)的氨氧化酶基因亚基A (amoA )克隆文库,并采用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP )技术分析了华北地区典型旱地冬小麦土壤中amoA 基因的多样性.采用MspI 和AfaI 两种限制性内切酶对amoA 基因克隆文库中阳性克隆子进行双酶切后,共得到了18 个氨氧化细菌的可操作分类单元(Operational Taxa Units, OTUs )和10 个氨氧化古菌可操作分类单元(Operational Taxa Units, OTUs ),其文库覆盖率分别达到92.9%和88.3%.氨氧化细菌的Shannon-Wiener 指数、丰富度指数、均匀度指数均高于氨氧化古菌.通过对文库中amoA细菌测序分析,所有的序列都属于Nitrosospira cluster 3 .而在氨氧化古菌中存在着一个绝对优势种群,它占到克隆文库的80 %,测序分析的结果表明,氨氧化古菌属于不可培养的泉古菌门.
通過構建氨氧化細菌(AOB )和氨氧化古菌(AOA)的氨氧化酶基因亞基A (amoA )剋隆文庫,併採用限製性片段長度多態性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP )技術分析瞭華北地區典型旱地鼕小麥土壤中amoA 基因的多樣性.採用MspI 和AfaI 兩種限製性內切酶對amoA 基因剋隆文庫中暘性剋隆子進行雙酶切後,共得到瞭18 箇氨氧化細菌的可操作分類單元(Operational Taxa Units, OTUs )和10 箇氨氧化古菌可操作分類單元(Operational Taxa Units, OTUs ),其文庫覆蓋率分彆達到92.9%和88.3%.氨氧化細菌的Shannon-Wiener 指數、豐富度指數、均勻度指數均高于氨氧化古菌.通過對文庫中amoA細菌測序分析,所有的序列都屬于Nitrosospira cluster 3 .而在氨氧化古菌中存在著一箇絕對優勢種群,它佔到剋隆文庫的80 %,測序分析的結果錶明,氨氧化古菌屬于不可培養的泉古菌門.
통과구건안양화세균(AOB )화안양화고균(AOA)적안양화매기인아기A (amoA )극륭문고,병채용한제성편단장도다태성(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP )기술분석료화북지구전형한지동소맥토양중amoA 기인적다양성.채용MspI 화AfaI 량충한제성내절매대amoA 기인극륭문고중양성극륭자진행쌍매절후,공득도료18 개안양화세균적가조작분류단원(Operational Taxa Units, OTUs )화10 개안양화고균가조작분류단원(Operational Taxa Units, OTUs ),기문고복개솔분별체도92.9%화88.3%.안양화세균적Shannon-Wiener 지수、봉부도지수、균균도지수균고우안양화고균.통과대문고중amoA세균측서분석,소유적서렬도속우Nitrosospira cluster 3 .이재안양화고균중존재착일개절대우세충군,타점도극륭문고적80 %,측서분석적결과표명,안양화고균속우불가배양적천고균문.
