褐家鼠汉坦病毒黑龙江SC106分离株S基因特征分析
갈가서한탄병독흑룡강SC106분리주S기인특정분석
S gene sequence analysis of a hantavirus strain isolated from rattus norvegicus in Heilongjiang area
  • 万方数据
    中国预防兽医学报 중국예방수의학보
    CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE
    2010年 8期 638-640 ,共3页

    陈淑红%彭永刚%陈露菲%刘娣%刘彦成%杨明%王开利%张静%李冀宏

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    褐家鼠%汉坦病毒%S基因%特征 褐傢鼠%漢坦病毒%S基因%特徵
    갈가서%한탄병독%S기인%특정
    为研究家鼠型(SEO)汉坦病毒(HV)黑龙江分离株的分子特征,本研究对黑龙江省SEO型新分离株SC106的S基因进行了扩增和序列分析.结果表明:SC106株S基因全长由1775 nt组成,编码的蛋白长429 aa,符合SEO型编码.与HV参考毒株进行比较,SC106与SEO型同源性最高,与姬鼠型(HTN)相对较低,与其它型别同源性更低.N蛋白进化树分析表明,SC106位于SEO型病毒所在支系,与河南株R22,黑龙江株Pf26和北京株BiHD01亲缘关系接近,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性.序列分析表明:SC106与黑龙江省首个SEO型分离株Pf26均为SEO型中的S1亚型,它们的S基因核苷酸序列同源性也最高(99.2%),并且SC106的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守,由此证实,HV的进化与时间关系不大.
    위연구가서형(SEO)한탄병독(HV)흑룡강분리주적분자특정,본연구대흑룡강성SEO형신분리주SC106적S기인진행료확증화서렬분석.결과표명:SC106주S기인전장유1775 nt조성,편마적단백장429 aa,부합SEO형편마.여HV삼고독주진행비교,SC106여SEO형동원성최고,여희서형(HTN)상대교저,여기타형별동원성경저.N단백진화수분석표명,SC106위우SEO형병독소재지계,여하남주R22,흑룡강주Pf26화북경주BiHD01친연관계접근,체현료일정적숙주의뢰성화지리족집성.서렬분석표명:SC106여흑룡강성수개SEO형분리주Pf26균위SEO형중적S1아형,타문적S기인핵감산서렬동원성야최고(99.2%),병차SC106적S기인편마적N단백안기산서렬야비교보수,유차증실,HV적진화여시간관계불대.
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