南昌大学学报（理科版）
南昌大學學報（理科版）
남창대학학보（이과판）
JOURNAL OF NANCHANG UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2012年
3期
245-249
,共5页
酪氨酸硝基化%信息熵%残基电荷性
酪氨痠硝基化%信息熵%殘基電荷性
락안산초기화%신식적%잔기전하성
采用氨基酸残基信息熵优化窗口,结合氨基酸的电荷性构建了蛋白质酪氨酸硝基化位点的预测模型.基于10-倍交叉验证,该模型的预测准确率和马氏相关系数分别达到了84.80％和69.69％.同时,对信息熵优化窗口和传统连续窗口进行了探讨,结果表明,信息熵窗口能够有效捕获酪氨酸硝基化肽段上的重要位点,克服短肽序列易丢失信息而单纯增大肽段长度又会引入冗余信息的矛盾,并最终提高模型的预测性能.特征分析揭示酪氨酸残基的局部静电环境、邻近的进化保守位点和长程位点对酪氨酸硝基化均有重要影响.
採用氨基痠殘基信息熵優化窗口,結閤氨基痠的電荷性構建瞭蛋白質酪氨痠硝基化位點的預測模型.基于10-倍交扠驗證,該模型的預測準確率和馬氏相關繫數分彆達到瞭84.80％和69.69％.同時,對信息熵優化窗口和傳統連續窗口進行瞭探討,結果錶明,信息熵窗口能夠有效捕穫酪氨痠硝基化肽段上的重要位點,剋服短肽序列易丟失信息而單純增大肽段長度又會引入冗餘信息的矛盾,併最終提高模型的預測性能.特徵分析揭示酪氨痠殘基的跼部靜電環境、鄰近的進化保守位點和長程位點對酪氨痠硝基化均有重要影響.
채용안기산잔기신식적우화창구,결합안기산적전하성구건료단백질락안산초기화위점적예측모형.기우10-배교차험증,해모형적예측준학솔화마씨상관계수분별체도료84.80％화69.69％.동시,대신식적우화창구화전통련속창구진행료탐토,결과표명,신식적창구능구유효포획락안산초기화태단상적중요위점,극복단태서렬역주실신식이단순증대태단장도우회인입용여신식적모순,병최종제고모형적예측성능.특정분석게시락안산잔기적국부정전배경、린근적진화보수위점화장정위점대락안산초기화균유중요영향.
