南方水产
南方水產
남방수산
SOUTH CHINA FISHERIES SCIENCE
2007年
1期
37-43
,共7页
鲷科%细胞色素b%种类鉴定
鯛科%細胞色素b%種類鑒定
조과%세포색소b%충류감정
从NCBI分子生物学数据库下载鲷科鱼类10属12种共24条Cyt b序列,通过序列比对最终获得1 070 bp的共有序列.其中,共检测到675个单态位点,393个变异位点,2个未知位点,没有检测到插入缺失.每个种具有的种特征性位点数为4到24个不等,平均约为12.42个.种间遗传距离分布范围为0.105±0.010(SE)到0.220±0.017(SE),均值为0.180±0.0231(SD),而种内遗传距离要小于或等于0.018±0.004(SE),均值为0.007±0.006(SD),因此,种间遗传距离要远远大于种内遗传距离.系统发育分析发现,来源于同一种内的2条序列都被聚为一个类群.以上分析显示不同鲷科种类能够通过Cyt b序列较好的进行区分,据此提出,当2个鲷科鱼类个体基于以上Cyt b序列计算得到的遗传距离如小于0.018时可以初步判断属于同一种,大于0.105则为不同种.研究为鲷科鱼类的分子种类鉴定提供了部分基础资料.
從NCBI分子生物學數據庫下載鯛科魚類10屬12種共24條Cyt b序列,通過序列比對最終穫得1 070 bp的共有序列.其中,共檢測到675箇單態位點,393箇變異位點,2箇未知位點,沒有檢測到插入缺失.每箇種具有的種特徵性位點數為4到24箇不等,平均約為12.42箇.種間遺傳距離分佈範圍為0.105±0.010(SE)到0.220±0.017(SE),均值為0.180±0.0231(SD),而種內遺傳距離要小于或等于0.018±0.004(SE),均值為0.007±0.006(SD),因此,種間遺傳距離要遠遠大于種內遺傳距離.繫統髮育分析髮現,來源于同一種內的2條序列都被聚為一箇類群.以上分析顯示不同鯛科種類能夠通過Cyt b序列較好的進行區分,據此提齣,噹2箇鯛科魚類箇體基于以上Cyt b序列計算得到的遺傳距離如小于0.018時可以初步判斷屬于同一種,大于0.105則為不同種.研究為鯛科魚類的分子種類鑒定提供瞭部分基礎資料.
종NCBI분자생물학수거고하재조과어류10속12충공24조Cyt b서렬,통과서렬비대최종획득1 070 bp적공유서렬.기중,공검측도675개단태위점,393개변이위점,2개미지위점,몰유검측도삽입결실.매개충구유적충특정성위점수위4도24개불등,평균약위12.42개.충간유전거리분포범위위0.105±0.010(SE)도0.220±0.017(SE),균치위0.180±0.0231(SD),이충내유전거리요소우혹등우0.018±0.004(SE),균치위0.007±0.006(SD),인차,충간유전거리요원원대우충내유전거리.계통발육분석발현,래원우동일충내적2조서렬도피취위일개류군.이상분석현시불동조과충류능구통과Cyt b서렬교호적진행구분,거차제출,당2개조과어류개체기우이상Cyt b서렬계산득도적유전거리여소우0.018시가이초보판단속우동일충,대우0.105칙위불동충.연구위조과어류적분자충류감정제공료부분기출자료.
