东北林业大学学报
東北林業大學學報
동북임업대학학보
JOURNAL OF NORTHEAST FORESTRY UNIVERSITY
2011年
3期
92-95
,共4页
王建琪%华育平%曾祥伟%张兰兰%程成%张玉稳
王建琪%華育平%曾祥偉%張蘭蘭%程成%張玉穩
왕건기%화육평%증상위%장란란%정성%장옥은
禽流感病毒%H3N8亚型%野鸭源分离株%序列分析
禽流感病毒%H3N8亞型%野鴨源分離株%序列分析
금류감병독%H3N8아형%야압원분리주%서렬분석
根据已知禽流感病毒(AIV)的8个基因序列设计合成12对特异引物,通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,分别成功扩增出分离于野鸭(Mallard)的1株H3N8亚型禽流感病毒的全基因片段,将其分别克隆到pMD18-T载体后进行序列测定.同时将8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较,绘制各基因的进化树.结果表明:所克隆到的8个片段均包含相应病毒基因的完整开放阅读框架,长度分别为PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp核苷酸,分别编码759、758、716、577、498、470、252/96、230/125个氨基酸.K/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株HA有7个潜在糖基化位点;在HA裂解位点序列为PEKQTR↓ GLF,无连续的多个碱性氨基酸插入,具有典型的低致病性禽流感病毒特征.根据A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株与参考毒株的序列比较分析结果推测,该分离株可能是不同亚型禽流感病毒通过互相基因交换所形成的基因重组体.
根據已知禽流感病毒(AIV)的8箇基因序列設計閤成12對特異引物,通過反轉錄-聚閤酶鏈式反應(RT-PCR)技術,分彆成功擴增齣分離于野鴨(Mallard)的1株H3N8亞型禽流感病毒的全基因片段,將其分彆剋隆到pMD18-T載體後進行序列測定.同時將8箇基因片段與GenBank髮錶的相應序列進行比較,繪製各基因的進化樹.結果錶明:所剋隆到的8箇片段均包含相應病毒基因的完整開放閱讀框架,長度分彆為PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp覈苷痠,分彆編碼759、758、716、577、498、470、252/96、230/125箇氨基痠.K/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株HA有7箇潛在糖基化位點;在HA裂解位點序列為PEKQTR↓ GLF,無連續的多箇堿性氨基痠插入,具有典型的低緻病性禽流感病毒特徵.根據A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株與參攷毒株的序列比較分析結果推測,該分離株可能是不同亞型禽流感病毒通過互相基因交換所形成的基因重組體.
근거이지금류감병독(AIV)적8개기인서렬설계합성12대특이인물,통과반전록-취합매련식반응(RT-PCR)기술,분별성공확증출분리우야압(Mallard)적1주H3N8아형금류감병독적전기인편단,장기분별극륭도pMD18-T재체후진행서렬측정.동시장8개기인편단여GenBank발표적상응서렬진행비교,회제각기인적진화수.결과표명:소극륭도적8개편단균포함상응병독기인적완정개방열독광가,장도분별위PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp핵감산,분별편마759、758、716、577、498、470、252/96、230/125개안기산.K/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)주HA유7개잠재당기화위점;재HA렬해위점서렬위PEKQTR↓ GLF,무련속적다개감성안기산삽입,구유전형적저치병성금류감병독특정.근거A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)주여삼고독주적서렬비교분석결과추측,해분리주가능시불동아형금류감병독통과호상기인교환소형성적기인중조체.
