中国地方病学杂志
中國地方病學雜誌
중국지방병학잡지
CHINESE JOURNAL OF ENDEMIOLOGY
2012年
4期
441-447
,共7页
赵鸿雁%杨杰%张旭%朴东日%田国忠%李金平%崔步云%姜海
趙鴻雁%楊傑%張旭%樸東日%田國忠%李金平%崔步雲%薑海
조홍안%양걸%장욱%박동일%전국충%리금평%최보운%강해
布鲁杆菌属%基因%多位点可变数目串联重复序列分析
佈魯桿菌屬%基因%多位點可變數目串聯重複序列分析
포로간균속%기인%다위점가변수목천련중복서렬분석
Brucella%Gene%Multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis
目的 建立多位点可变数目串联重复序列分析方法(MLVA),并评价其在布鲁杆菌菌株鉴定及流行病溯源中的价值.方法 使用MLVA方法,对16株羊种菌、22株牛种菌、21株猪种菌和10株犬种菌株进行分析,使用BioNumerics(Version 5.0),对16个位点进行聚类分析,聚类方式用平均连锁聚类法(UPGMA).计算每个位点的差异指数,菌株的基因型通过MLVA2010数据库确定.结果 使用MLVA方法,通过Bruce06、Bruce08、Bruce11、Bruce12、Bruce42、Bruce43、Bruce45、Bruce55共8个位点可以区分布鲁杆菌的种;通过Bruce04、Bruce07、Bruce09、Bruce 16、Bruce30共5个位点可以对菌株进行溯源,确定菌株流行病学相关性.结论 MLVA技术是一种分辨率高且易于在省级疾病防控系统监测实验室使用的标准化分型技术,可以加强布病监测能力.
目的 建立多位點可變數目串聯重複序列分析方法(MLVA),併評價其在佈魯桿菌菌株鑒定及流行病溯源中的價值.方法 使用MLVA方法,對16株羊種菌、22株牛種菌、21株豬種菌和10株犬種菌株進行分析,使用BioNumerics(Version 5.0),對16箇位點進行聚類分析,聚類方式用平均連鎖聚類法(UPGMA).計算每箇位點的差異指數,菌株的基因型通過MLVA2010數據庫確定.結果 使用MLVA方法,通過Bruce06、Bruce08、Bruce11、Bruce12、Bruce42、Bruce43、Bruce45、Bruce55共8箇位點可以區分佈魯桿菌的種;通過Bruce04、Bruce07、Bruce09、Bruce 16、Bruce30共5箇位點可以對菌株進行溯源,確定菌株流行病學相關性.結論 MLVA技術是一種分辨率高且易于在省級疾病防控繫統鑑測實驗室使用的標準化分型技術,可以加彊佈病鑑測能力.
목적 건립다위점가변수목천련중복서렬분석방법(MLVA),병평개기재포로간균균주감정급류행병소원중적개치.방법 사용MLVA방법,대16주양충균、22주우충균、21주저충균화10주견충균주진행분석,사용BioNumerics(Version 5.0),대16개위점진행취류분석,취류방식용평균련쇄취류법(UPGMA).계산매개위점적차이지수,균주적기인형통과MLVA2010수거고학정.결과 사용MLVA방법,통과Bruce06、Bruce08、Bruce11、Bruce12、Bruce42、Bruce43、Bruce45、Bruce55공8개위점가이구분포로간균적충;통과Bruce04、Bruce07、Bruce09、Bruce 16、Bruce30공5개위점가이대균주진행소원,학정균주류행병학상관성.결론 MLVA기술시일충분변솔고차역우재성급질병방공계통감측실험실사용적표준화분형기술,가이가강포병감측능력.
Objective To establish the standard operating procedures on multiple locus variable number tandem repeat analysis and to evaluate the values in identification of Brucella(B.) melitensis and epidemiological trace-back.Methods Sixteen B.melitensis,22 B.abortus,21 B.suis and 10 B.cnais were investigated by Brucella MLVA-16 genotyping scheme.All data were analyzed using BioNumerics version 5.1 software (AppliedMaths,Belgium).Clustering analysis was based on the categorical coefficient and unweighted pair group method using arithmetic averages(UPGMA) method.Polymorphism at each locus was quantified using Nei's diversity index.Resultant genotypes were compared using the web-based Brucella 2010 MLVA database.Results MLVA methods were successfully established and some strains can be clustered.Bruce06,bruce08,bruce11,bruce12,bruce42,bruce43,bruce45 and bruce55 were useful for species identification of Brucella isolates.Bruce04,bruce07,bruce09,bruce16 and bruce 30 afforded a higher discriminatory power for investigation of strain relatedness in regions of endemicity.Conclusions The MLVA method has proved to be highly discriminatory and epidemiological concordance and is easy for Brucellosis surveillance in province-level lab.
