核农学报
覈農學報
핵농학보
ACTA AGRICULTURAE NUCLEATAE SINICA
2008年
2期
141-147
,共7页
刘汉梅%何瑞%赵耀%张怀渝%黄玉碧
劉漢梅%何瑞%趙耀%張懷渝%黃玉碧
류한매%하서%조요%장부투%황옥벽
玉米%密码子用法%密码子偏爱性
玉米%密碼子用法%密碼子偏愛性
옥미%밀마자용법%밀마자편애성
生物中普遍存在密码子使用偏性,这对外源基因的表达强度有着较大影响.本研究运用CodonW软件和CUSP程序对玉米基因组中的7402个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算了编码氨基酸的密码子使用频率,并将其与人、酵母、大肠杆菌、果蝇等不同种类的模式生物及与拟南芥、烟草、水稻、小麦等双、单子叶植物进行比较,结果显示玉米密码子偏爱性与模式生物有不同程度的差异,与拟南芥、烟草双子叶植物的密码子使用频率差异较大,与水稻、小麦单子叶植物的密码子偏爱性一致.分析结果对玉米基因的转化及高效表达系统的选择等具有重要指导意义.
生物中普遍存在密碼子使用偏性,這對外源基因的錶達彊度有著較大影響.本研究運用CodonW軟件和CUSP程序對玉米基因組中的7402箇蛋白質編碼基因序列進行瞭分析,計算瞭編碼氨基痠的密碼子使用頻率,併將其與人、酵母、大腸桿菌、果蠅等不同種類的模式生物及與擬南芥、煙草、水稻、小麥等雙、單子葉植物進行比較,結果顯示玉米密碼子偏愛性與模式生物有不同程度的差異,與擬南芥、煙草雙子葉植物的密碼子使用頻率差異較大,與水稻、小麥單子葉植物的密碼子偏愛性一緻.分析結果對玉米基因的轉化及高效錶達繫統的選擇等具有重要指導意義.
생물중보편존재밀마자사용편성,저대외원기인적표체강도유착교대영향.본연구운용CodonW연건화CUSP정서대옥미기인조중적7402개단백질편마기인서렬진행료분석,계산료편마안기산적밀마자사용빈솔,병장기여인、효모、대장간균、과승등불동충류적모식생물급여의남개、연초、수도、소맥등쌍、단자협식물진행비교,결과현시옥미밀마자편애성여모식생물유불동정도적차이,여의남개、연초쌍자협식물적밀마자사용빈솔차이교대,여수도、소맥단자협식물적밀마자편애성일치.분석결과대옥미기인적전화급고효표체계통적선택등구유중요지도의의.