CAJ | 학술논문

采用两种方法提取中国结核合同区东区沉积物不同层次总DNA,通过克隆测序构建了含有79个克隆子的细菌16S rRNA基因文库,分析了该海域沉积物中细菌的多样性.79个克隆在系统发育树中形成了11个大分支,包括Gamma proteobacteria(22.8%),Alpha proteobacteria(16.5%),Planctomycetacia(7.6%),Delta proteobacteria(6.3%), Nitrospira(6.3%),Actinobacteria(6.3%),Beta proteobacteria(5%),Acidobacteria(5.1%),Sphingobacteria(3.8%),Firmicutes(2.5%),Other bacteria(17.7%),其中Gamma proteobacteria在总文库中所占比例最高,该分支细菌在0～2cm、4～6cm层也是优势菌种.Gamma proteobacteria中假单胞菌(Pseudomonas)为优势属(22.2%).各个层次中所含细菌类群有所不同,Alpha proteobacteria、Gamma proteobacteria、Delta proteobacteria 、Planctomycetacia、Nitrospira 、Actinobacteria和Acidobacteria为三层样品共有类群.
채용량충방법제취중국결핵합동구동구침적물불동층차총DNA,통과극륭측서구건료함유79개극륭자적세균16S rRNA기인문고,분석료해해역침적물중세균적다양성.79개극륭재계통발육수중형성료11개대분지,포괄Gamma proteobacteria(22.8%),Alpha proteobacteria(16.5%),Planctomycetacia(7.6%),Delta proteobacteria(6.3%), Nitrospira(6.3%),Actinobacteria(6.3%),Beta proteobacteria(5%),Acidobacteria(5.1%),Sphingobacteria(3.8%),Firmicutes(2.5%),Other bacteria(17.7%),기중Gamma proteobacteria재총문고중소점비례최고,해분지세균재0～2cm、4～6cm층야시우세균충.Gamma proteobacteria중가단포균(Pseudomonas)위우세속(22.2%).각개층차중소함세균류군유소불동,Alpha proteobacteria、Gamma proteobacteria、Delta proteobacteria 、Planctomycetacia、Nitrospira 、Actinobacteria화Acidobacteria위삼층양품공유류군.