生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2007年
1期
8-11
,共4页
AROM蛋白%核盘菌%结构建模
AROM蛋白%覈盤菌%結構建模
AROM단백%핵반균%결구건모
核盘菌编码AROM蛋白的arom基因已经被克隆测序,本文根据该基因翻译的氨基酸序列用同源模建方法和从头模建方法分析了AROM蛋白各结构域的三级结构和功能位点,以及该蛋白二聚体可能的组装方式.结果表明,核盘菌AROM蛋白的脱氢奎尼酸合酶结构域进一步由N-端含有一个Rossmann折叠的α/β结构域和C-端的α螺旋结构域组成;5-烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合酶结构域则由两个相似结构域组成,每个结构域含有不同拷贝数的β折叠和α螺旋;莽草酸激酶结构域的N-端由三个β折叠组成;脱氢奎尼酸酶结构域为(α2β2)3多肽,在N-端有一对反平行的β链,在C-端有loop环;莽草酸脱氢酶结构域含有一个由α/β组成的催化结构域和一个含有Rossmann折叠的NADPH结合结构域.
覈盤菌編碼AROM蛋白的arom基因已經被剋隆測序,本文根據該基因翻譯的氨基痠序列用同源模建方法和從頭模建方法分析瞭AROM蛋白各結構域的三級結構和功能位點,以及該蛋白二聚體可能的組裝方式.結果錶明,覈盤菌AROM蛋白的脫氫奎尼痠閤酶結構域進一步由N-耑含有一箇Rossmann摺疊的α/β結構域和C-耑的α螺鏇結構域組成;5-烯醇丙酮酰莽草痠-3-燐痠閤酶結構域則由兩箇相似結構域組成,每箇結構域含有不同拷貝數的β摺疊和α螺鏇;莽草痠激酶結構域的N-耑由三箇β摺疊組成;脫氫奎尼痠酶結構域為(α2β2)3多肽,在N-耑有一對反平行的β鏈,在C-耑有loop環;莽草痠脫氫酶結構域含有一箇由α/β組成的催化結構域和一箇含有Rossmann摺疊的NADPH結閤結構域.
핵반균편마AROM단백적arom기인이경피극륭측서,본문근거해기인번역적안기산서렬용동원모건방법화종두모건방법분석료AROM단백각결구역적삼급결구화공능위점,이급해단백이취체가능적조장방식.결과표명,핵반균AROM단백적탈경규니산합매결구역진일보유N-단함유일개Rossmann절첩적α/β결구역화C-단적α라선결구역조성;5-희순병동선망초산-3-린산합매결구역칙유량개상사결구역조성,매개결구역함유불동고패수적β절첩화α라선;망초산격매결구역적N-단유삼개β절첩조성;탈경규니산매결구역위(α2β2)3다태,재N-단유일대반평행적β련,재C-단유loop배;망초산탈경매결구역함유일개유α/β조성적최화결구역화일개함유Rossmann절첩적NADPH결합결구역.
