中国海洋大学学报(自然科学版)
中國海洋大學學報(自然科學版)
중국해양대학학보(자연과학판)
PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2008年
5期
855-860
,共6页
DNA序列%图形表示%氨基酸%相似性分析%进化树
DNA序列%圖形錶示%氨基痠%相似性分析%進化樹
DNA서렬%도형표시%안기산%상사성분석%진화수
基于氨基酸的物理化学性质,将氨基酸分为4类,疏水,带电荷,有极性,甘氨酸,在此基础上给出DNA序列一种新的图形表示方法:将1列DNA序列表示为二维空间中的3条特征曲线,利用计算C(i,j)矩阵的主特征值,给出DNA序列的3维特征向量,得到相似距离矩阵.最后计算10种不同物种β-球蛋白第一段外显子的欧式空间距离矩阵D(i,j),并利用UPGMA算法给出了这10种不同物种基于这种相似关系的系统发生树.
基于氨基痠的物理化學性質,將氨基痠分為4類,疏水,帶電荷,有極性,甘氨痠,在此基礎上給齣DNA序列一種新的圖形錶示方法:將1列DNA序列錶示為二維空間中的3條特徵麯線,利用計算C(i,j)矩陣的主特徵值,給齣DNA序列的3維特徵嚮量,得到相似距離矩陣.最後計算10種不同物種β-毬蛋白第一段外顯子的歐式空間距離矩陣D(i,j),併利用UPGMA算法給齣瞭這10種不同物種基于這種相似關繫的繫統髮生樹.
기우안기산적물이화학성질,장안기산분위4류,소수,대전하,유겁성,감안산,재차기출상급출DNA서렬일충신적도형표시방법:장1렬DNA서렬표시위이유공간중적3조특정곡선,이용계산C(i,j)구진적주특정치,급출DNA서렬적3유특정향량,득도상사거리구진.최후계산10충불동물충β-구단백제일단외현자적구식공간거리구진D(i,j),병이용UPGMA산법급출료저10충불동물충기우저충상사관계적계통발생수.