中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2010年
5期
442-446
,共5页
周建华%刘永生%陈豪泰%马丽娜%张杰
週建華%劉永生%陳豪泰%馬麗娜%張傑
주건화%류영생%진호태%마려나%장걸
口蹄疫病毒%密码子使用%密码子相对使用概率%氨基酸使用相对概率%方差分析
口蹄疫病毒%密碼子使用%密碼子相對使用概率%氨基痠使用相對概率%方差分析
구제역병독%밀마자사용%밀마자상대사용개솔%안기산사용상대개솔%방차분석
对于54个编码口蹄疫病毒 O型和A型多聚蛋白质编码序列密码子使用的方差分析表明,这两种血清型多聚蛋白质的密码子(GCC、GCG、AGA、CGG、GGC、GGU、CAC、CAU、AUA、AUU、CUG、CCC、AGC、UCU、ACA、ACC、ACG、ACU)使用偏性有显著区别.然而,通过对氨基酸使用偏性的分析,我们只是找出Ala、Arg、Leu、Phe、Ser在O和A型多聚蛋白质中的使用偏性有显著差异.由此我们发现,密码子的使用偏性比氨基酸使用偏性能提供更多的信息.通过对A型和O型的密码子使用整体性分析,两者密码子使用偏性的相似性可能与tRNA丰度相关的.这些密码子使用偏性的内在联系表明口蹄疫病毒 A型和O型的基因组变异所涉及到同义密码子的选择上可能存在着某种选择机制.
對于54箇編碼口蹄疫病毒 O型和A型多聚蛋白質編碼序列密碼子使用的方差分析錶明,這兩種血清型多聚蛋白質的密碼子(GCC、GCG、AGA、CGG、GGC、GGU、CAC、CAU、AUA、AUU、CUG、CCC、AGC、UCU、ACA、ACC、ACG、ACU)使用偏性有顯著區彆.然而,通過對氨基痠使用偏性的分析,我們隻是找齣Ala、Arg、Leu、Phe、Ser在O和A型多聚蛋白質中的使用偏性有顯著差異.由此我們髮現,密碼子的使用偏性比氨基痠使用偏性能提供更多的信息.通過對A型和O型的密碼子使用整體性分析,兩者密碼子使用偏性的相似性可能與tRNA豐度相關的.這些密碼子使用偏性的內在聯繫錶明口蹄疫病毒 A型和O型的基因組變異所涉及到同義密碼子的選擇上可能存在著某種選擇機製.
대우54개편마구제역병독 O형화A형다취단백질편마서렬밀마자사용적방차분석표명,저량충혈청형다취단백질적밀마자(GCC、GCG、AGA、CGG、GGC、GGU、CAC、CAU、AUA、AUU、CUG、CCC、AGC、UCU、ACA、ACC、ACG、ACU)사용편성유현저구별.연이,통과대안기산사용편성적분석,아문지시조출Ala、Arg、Leu、Phe、Ser재O화A형다취단백질중적사용편성유현저차이.유차아문발현,밀마자적사용편성비안기산사용편성능제공경다적신식.통과대A형화O형적밀마자사용정체성분석,량자밀마자사용편성적상사성가능여tRNA봉도상관적.저사밀마자사용편성적내재련계표명구제역병독 A형화O형적기인조변이소섭급도동의밀마자적선택상가능존재착모충선택궤제.
