小麦抗白粉病基因pm42的EST连锁图谱构建和比较基因组学分析
소맥항백분병기인pm42적EST련쇄도보구건화비교기인조학분석
Comparative Genomics Analysis and Constructing EST Markers Linkage Map of Powdery Mildew Resistance Gene pm42 in Wheat
  • 万方数据
    作物学报 작물학보
    ACTA AGRONOMICA SINICA
    2011年 9期 1569-1576 ,共8页

    刘子记%朱婕%华为%杨作民%孙其信%刘志勇

    류자기%주첩%화위%양작민%손기신%류지용

    小麦抗白粉病基因%pm42%比较基因组学%二穗短柄草%共线性%EST-STS%EST-SSCP 小麥抗白粉病基因%pm42%比較基因組學%二穗短柄草%共線性%EST-STS%EST-SSCP
    소맥항백분병기인%pm42%비교기인조학%이수단병초%공선성%EST-STS%EST-SSCP
    目的基因精细遗传连锁图谱的构建是图位克隆的基础,小麦功能基因精细遗传连锁图谱的构建依赖于比较基因组学分析.水稻和短柄草(Brachypodium distachyon)基因组序列是小麦比较基因组学分析和功能基因精细遗传定位的重要工具.本研究利用小麦、短柄草和水稻的基因组共线性关系对小麦抗白粉病基因pm42进行比较基因组学分析,明确了pm42基因所在2BS基因组区域与短柄草第1染色体和水稻第3染色体直系同源基因组区域的对应关系,开发出与抗白粉病基因pm42连锁的EST-SSCP (expressed sequence tag-single strand conformation polymorphism)标记CD452782和BF201235,以及EST-STS (expressed sequence tag-sequence tagged site)标记CJ674042、EB513371和CV771633,构建了pm42基因EST标记遗传连锁图谱,CJ674042、BF201235、CD452782和CV771633位于pm42近端粒侧,距离pm42的遗传距离分别为1.9、12.0、19.7和25.7 cM; EB513371位于pm42近着丝粒侧,与pm42的遗传距离为14.6 cM.整合原有的作图数据,构建了pm42基因的高密度比较基因组学遗传连锁图谱,pm42被定位于3.3 cM的区间,该区间对应于短柄草66 kb的基因组区域及水稻69 kb的基因组区域.该结果为抗白粉病基因pm42高密度精细遗传连锁图谱构建、分子辅助选择和基因聚合奠定了基础.
    목적기인정세유전련쇄도보적구건시도위극륭적기출,소맥공능기인정세유전련쇄도보적구건의뢰우비교기인조학분석.수도화단병초(Brachypodium distachyon)기인조서렬시소맥비교기인조학분석화공능기인정세유전정위적중요공구.본연구이용소맥、단병초화수도적기인조공선성관계대소맥항백분병기인pm42진행비교기인조학분석,명학료pm42기인소재2BS기인조구역여단병초제1염색체화수도제3염색체직계동원기인조구역적대응관계,개발출여항백분병기인pm42련쇄적EST-SSCP (expressed sequence tag-single strand conformation polymorphism)표기CD452782화BF201235,이급EST-STS (expressed sequence tag-sequence tagged site)표기CJ674042、EB513371화CV771633,구건료pm42기인EST표기유전련쇄도보,CJ674042、BF201235、CD452782화CV771633위우pm42근단립측,거리pm42적유전거리분별위1.9、12.0、19.7화25.7 cM; EB513371위우pm42근착사립측,여pm42적유전거리위14.6 cM.정합원유적작도수거,구건료pm42기인적고밀도비교기인조학유전련쇄도보,pm42피정위우3.3 cM적구간,해구간대응우단병초66 kb적기인조구역급수도69 kb적기인조구역.해결과위항백분병기인pm42고밀도정세유전련쇄도보구건、분자보조선택화기인취합전정료기출.
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