第四军医大学学报
第四軍醫大學學報
제사군의대학학보
JOURNAL OF THE FOURTH MILITARY MEDICAL UNIVERSITY
2007年
4期
313-316
,共4页
王忠东%郭红延%吴纪楠%凌均棨%肖明振%郭希民%柴玉波
王忠東%郭紅延%吳紀楠%凌均棨%肖明振%郭希民%柴玉波
왕충동%곽홍연%오기남%릉균계%초명진%곽희민%시옥파
牙髓/细胞学%牙龈%成纤维细胞%基因文库%序列分析%BLAST分析
牙髓/細胞學%牙齦%成纖維細胞%基因文庫%序列分析%BLAST分析
아수/세포학%아간%성섬유세포%기인문고%서렬분석%BLAST분석
目的:在人牙髓细胞中克隆DPDP-2基因,研究其可能的功能.方法:体外培养HDPC和人牙龈成纤维细胞(HGF),应用基于PCR的改良消减杂交技术构建HDPC和HGF cDNA消减文库,批量克隆HDPC和HGF的差异表达基因并测序,使用GenBank的BLAST对测序结果进行同源序列比较,并运用计算机软件PC/GENE 6.60版对筛选到的DPDP-2基因进行结构和功能分析.结果:DPDP-2基因序列全长810 bp,没有一个完整的编码区. 可与KIAA0265 gene拼接成一个长6172 bp的完整序列,编码一个含有83个氨基酸的疏水性蛋白,其二级结构由螺旋结构、卷曲结构和伸展部分所组成. 它们可以通过α,β或α/β折叠而形成三级结构. 抗原表位分析发现它可能有3种抗原决定簇结构,即Glu-Asn-Lys-Arg-Thr-Gly,Leu-Ile-Glu-Arg-Leu-Lys和Glu-Leu-Ala-Trp-Glu-Lys. 该蛋白存在一种跨膜螺旋结构和线粒体运输肽结构. 进一步的分泌信号分析结果也证实它是一种非分泌蛋白. 经BLAST同源蛋白质搜索,在Non-redundant SwissProt sequences和PDB protein database中均未查询到同源蛋白质.结论:DPDP-2所编码的蛋白是一种跨膜蛋白,具有信号转导分子的结构特征,又具有CKⅡ的磷酸化位点,可能与细胞分裂、转录调节过程有关.
目的:在人牙髓細胞中剋隆DPDP-2基因,研究其可能的功能.方法:體外培養HDPC和人牙齦成纖維細胞(HGF),應用基于PCR的改良消減雜交技術構建HDPC和HGF cDNA消減文庫,批量剋隆HDPC和HGF的差異錶達基因併測序,使用GenBank的BLAST對測序結果進行同源序列比較,併運用計算機軟件PC/GENE 6.60版對篩選到的DPDP-2基因進行結構和功能分析.結果:DPDP-2基因序列全長810 bp,沒有一箇完整的編碼區. 可與KIAA0265 gene拼接成一箇長6172 bp的完整序列,編碼一箇含有83箇氨基痠的疏水性蛋白,其二級結構由螺鏇結構、捲麯結構和伸展部分所組成. 它們可以通過α,β或α/β摺疊而形成三級結構. 抗原錶位分析髮現它可能有3種抗原決定簇結構,即Glu-Asn-Lys-Arg-Thr-Gly,Leu-Ile-Glu-Arg-Leu-Lys和Glu-Leu-Ala-Trp-Glu-Lys. 該蛋白存在一種跨膜螺鏇結構和線粒體運輸肽結構. 進一步的分泌信號分析結果也證實它是一種非分泌蛋白. 經BLAST同源蛋白質搜索,在Non-redundant SwissProt sequences和PDB protein database中均未查詢到同源蛋白質.結論:DPDP-2所編碼的蛋白是一種跨膜蛋白,具有信號轉導分子的結構特徵,又具有CKⅡ的燐痠化位點,可能與細胞分裂、轉錄調節過程有關.
목적:재인아수세포중극륭DPDP-2기인,연구기가능적공능.방법:체외배양HDPC화인아간성섬유세포(HGF),응용기우PCR적개량소감잡교기술구건HDPC화HGF cDNA소감문고,비량극륭HDPC화HGF적차이표체기인병측서,사용GenBank적BLAST대측서결과진행동원서렬비교,병운용계산궤연건PC/GENE 6.60판대사선도적DPDP-2기인진행결구화공능분석.결과:DPDP-2기인서렬전장810 bp,몰유일개완정적편마구. 가여KIAA0265 gene병접성일개장6172 bp적완정서렬,편마일개함유83개안기산적소수성단백,기이급결구유라선결구、권곡결구화신전부분소조성. 타문가이통과α,β혹α/β절첩이형성삼급결구. 항원표위분석발현타가능유3충항원결정족결구,즉Glu-Asn-Lys-Arg-Thr-Gly,Leu-Ile-Glu-Arg-Leu-Lys화Glu-Leu-Ala-Trp-Glu-Lys. 해단백존재일충과막라선결구화선립체운수태결구. 진일보적분비신호분석결과야증실타시일충비분비단백. 경BLAST동원단백질수색,재Non-redundant SwissProt sequences화PDB protein database중균미사순도동원단백질.결론:DPDP-2소편마적단백시일충과막단백,구유신호전도분자적결구특정,우구유CKⅡ적린산화위점,가능여세포분렬、전록조절과정유관.