生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2012年
3期
211-216
,共6页
启动子预测%真核生物%CpG岛%区间位置权重矩阵
啟動子預測%真覈生物%CpG島%區間位置權重矩陣
계동자예측%진핵생물%CpG도%구간위치권중구진
基于启动子的以下特点:(1)启动子区域有一些一致序列,但对于不同的启动子,一致序列在个别碱基上会有所改变,具有多样性;(2)一致序列的位置并不固定,总是在某个范围内波动;(3)大部分的真核生物启动子都和CpG岛有关.提出了一个新的启动子预测方法,即采用了一种新的统计建模策略,并首次提出了区间位置权重矩阵(IPWM)概率模型.大规模序列测试结果表明,新的启动子预测系统具有较好的敏感性和特异性.
基于啟動子的以下特點:(1)啟動子區域有一些一緻序列,但對于不同的啟動子,一緻序列在箇彆堿基上會有所改變,具有多樣性;(2)一緻序列的位置併不固定,總是在某箇範圍內波動;(3)大部分的真覈生物啟動子都和CpG島有關.提齣瞭一箇新的啟動子預測方法,即採用瞭一種新的統計建模策略,併首次提齣瞭區間位置權重矩陣(IPWM)概率模型.大規模序列測試結果錶明,新的啟動子預測繫統具有較好的敏感性和特異性.
기우계동자적이하특점:(1)계동자구역유일사일치서렬,단대우불동적계동자,일치서렬재개별감기상회유소개변,구유다양성;(2)일치서렬적위치병불고정,총시재모개범위내파동;(3)대부분적진핵생물계동자도화CpG도유관.제출료일개신적계동자예측방법,즉채용료일충신적통계건모책략,병수차제출료구간위치권중구진(IPWM)개솔모형.대규모서렬측시결과표명,신적계동자예측계통구유교호적민감성화특이성.
