计算机应用研究
計算機應用研究
계산궤응용연구
APPLICATION RESEARCH OF COMPUTERS
2011年
2期
465-468
,共4页
王栋%孙济洲%李福超%宋婷
王棟%孫濟洲%李福超%宋婷
왕동%손제주%리복초%송정
蛋白质结构预测%多类支持向量机%并行计算%远同源检测
蛋白質結構預測%多類支持嚮量機%併行計算%遠同源檢測
단백질결구예측%다류지지향량궤%병행계산%원동원검측
在远同源检测的蛋白质结构预测方法中,基于支持向量机的方法取得了优于其他方法的高准确性,但这类方法只能完成对目标蛋白质作出是否属于特定蛋白质结构的判别,而实际应用中常需要直接给出具体的结构预测结果.提出一种基于多类支持向量机的蛋白质结构预测方法,通过采用加权一对多的多类分类方法对标准支持向量机输出结果进行综合评价,获得唯一的结构预测结果;同时为了克服算法复杂性高的弱点,用并行计算的思想对算法进行了优化.实验表明,基于并行多类支持向量机的蛋白质结构预测取得了更高的准确性,并行化的处理提高了多类支持向量机分类器的性能.
在遠同源檢測的蛋白質結構預測方法中,基于支持嚮量機的方法取得瞭優于其他方法的高準確性,但這類方法隻能完成對目標蛋白質作齣是否屬于特定蛋白質結構的判彆,而實際應用中常需要直接給齣具體的結構預測結果.提齣一種基于多類支持嚮量機的蛋白質結構預測方法,通過採用加權一對多的多類分類方法對標準支持嚮量機輸齣結果進行綜閤評價,穫得唯一的結構預測結果;同時為瞭剋服算法複雜性高的弱點,用併行計算的思想對算法進行瞭優化.實驗錶明,基于併行多類支持嚮量機的蛋白質結構預測取得瞭更高的準確性,併行化的處理提高瞭多類支持嚮量機分類器的性能.
재원동원검측적단백질결구예측방법중,기우지지향량궤적방법취득료우우기타방법적고준학성,단저류방법지능완성대목표단백질작출시부속우특정단백질결구적판별,이실제응용중상수요직접급출구체적결구예측결과.제출일충기우다류지지향량궤적단백질결구예측방법,통과채용가권일대다적다류분류방법대표준지지향량궤수출결과진행종합평개,획득유일적결구예측결과;동시위료극복산법복잡성고적약점,용병행계산적사상대산법진행료우화.실험표명,기우병행다류지지향량궤적단백질결구예측취득료경고적준학성,병행화적처리제고료다류지지향량궤분류기적성능.
