东北林业大学学报
東北林業大學學報
동북임업대학학보
JOURNAL OF NORTHEAST FORESTRY UNIVERSITY
2012年
8期
40-46
,共7页
张华%谢利娟%刘晓娇%崔士超
張華%謝利娟%劉曉嬌%崔士超
장화%사리연%류효교%최사초
月季%丝氨酸蛋白酶%基因克隆%生物信息学
月季%絲氨痠蛋白酶%基因剋隆%生物信息學
월계%사안산단백매%기인극륭%생물신식학
利用RT-PCR技术,从切花月季品种“Samantha”中克隆丝氨酸蛋白酶基因RhSep1.利用生物信息学技术对所得到的丝氨酸蛋白酶RhSep1序列进行结构与功能预测.结果表明:RhSep1基因全长2442 bp,开放阅读框编码769个氨基酸,推定该丝氨酸蛋白酶分子质量为80.48 kD.通过NCBI和MEROPS肽酶数据库等对RhSep1进行Protein Blast,发现RhSep1具有肽酶S8_3家族SA的典型结构域Petidase_S8_3(序列为Tyr-108-Leu-341)和PA_subtilisin_like的结构域(序列为Tyr-348-Ile-474).预测RhSep1可能具有信号肽、明显疏水区和典型跨膜区,同时RhSep1氨基酸序列中存在较多蛋白激酶C和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、豆蔻酰化位点.这些活性位点往往与蛋白的磷酸化、G蛋白相互作用等信号转导事件有关,RhSep1可能存在复杂的蛋白水平调控机制.
利用RT-PCR技術,從切花月季品種“Samantha”中剋隆絲氨痠蛋白酶基因RhSep1.利用生物信息學技術對所得到的絲氨痠蛋白酶RhSep1序列進行結構與功能預測.結果錶明:RhSep1基因全長2442 bp,開放閱讀框編碼769箇氨基痠,推定該絲氨痠蛋白酶分子質量為80.48 kD.通過NCBI和MEROPS肽酶數據庫等對RhSep1進行Protein Blast,髮現RhSep1具有肽酶S8_3傢族SA的典型結構域Petidase_S8_3(序列為Tyr-108-Leu-341)和PA_subtilisin_like的結構域(序列為Tyr-348-Ile-474).預測RhSep1可能具有信號肽、明顯疏水區和典型跨膜區,同時RhSep1氨基痠序列中存在較多蛋白激酶C和酪蛋白激酶Ⅱ燐痠化位點、豆蔻酰化位點.這些活性位點往往與蛋白的燐痠化、G蛋白相互作用等信號轉導事件有關,RhSep1可能存在複雜的蛋白水平調控機製.
이용RT-PCR기술,종절화월계품충“Samantha”중극륭사안산단백매기인RhSep1.이용생물신식학기술대소득도적사안산단백매RhSep1서렬진행결구여공능예측.결과표명:RhSep1기인전장2442 bp,개방열독광편마769개안기산,추정해사안산단백매분자질량위80.48 kD.통과NCBI화MEROPS태매수거고등대RhSep1진행Protein Blast,발현RhSep1구유태매S8_3가족SA적전형결구역Petidase_S8_3(서렬위Tyr-108-Leu-341)화PA_subtilisin_like적결구역(서렬위Tyr-348-Ile-474).예측RhSep1가능구유신호태、명현소수구화전형과막구,동시RhSep1안기산서렬중존재교다단백격매C화락단백격매Ⅱ린산화위점、두구선화위점.저사활성위점왕왕여단백적린산화、G단백상호작용등신호전도사건유관,RhSep1가능존재복잡적단백수평조공궤제.
