中国农业科技导报
中國農業科技導報
중국농업과기도보
REVIEW OF CHINA AGRICULTURAL SCIENCE AND TECHNOLOGY
2008年
5期
45-52
,共8页
燕永亮%杨剑%窦岳坦%平淑珍%王忆平%金奇%林敏
燕永亮%楊劍%竇嶽坦%平淑珍%王憶平%金奇%林敏
연영량%양검%두악탄%평숙진%왕억평%금기%림민
基因组测序%斯氏假单胞菌A1501%联合固氮%比较基因组学
基因組測序%斯氏假單胞菌A1501%聯閤固氮%比較基因組學
기인조측서%사씨가단포균A1501%연합고담%비교기인조학
采用全基因组"shotgun"方法完成了固氮斯氏假单胞菌A1501的全基因组序列测定,并进行了基因组结构与功能注释分析.A1501基因组伞长4 567 418 bp,含有4 146个ORFs.该基因组中已鉴定了42个编码转座酶的重复序列,这些序列的存在预示着转座现象在A1501菌中非常活跃,预示该菌与其他生物之间基因交流可能比较频繁.比较基因组表明,为了适应特定的生存环境,假单胞菌在基因组结构和遗传信息容量上产生了明显的分化.此外,基因组分析鉴定了A1501环境适应的遗传基础,包括物质转运、信号传导和趋化系统等,这些系统是细菌能够在根际土壤环境中保持竞争力以及能够与水稻形成高效联合固氮体系的关键.A1501基因组的完成为进一步开展功能基因组学和蛋白质组学研究奠定了基础.
採用全基因組"shotgun"方法完成瞭固氮斯氏假單胞菌A1501的全基因組序列測定,併進行瞭基因組結構與功能註釋分析.A1501基因組傘長4 567 418 bp,含有4 146箇ORFs.該基因組中已鑒定瞭42箇編碼轉座酶的重複序列,這些序列的存在預示著轉座現象在A1501菌中非常活躍,預示該菌與其他生物之間基因交流可能比較頻繁.比較基因組錶明,為瞭適應特定的生存環境,假單胞菌在基因組結構和遺傳信息容量上產生瞭明顯的分化.此外,基因組分析鑒定瞭A1501環境適應的遺傳基礎,包括物質轉運、信號傳導和趨化繫統等,這些繫統是細菌能夠在根際土壤環境中保持競爭力以及能夠與水稻形成高效聯閤固氮體繫的關鍵.A1501基因組的完成為進一步開展功能基因組學和蛋白質組學研究奠定瞭基礎.
채용전기인조"shotgun"방법완성료고담사씨가단포균A1501적전기인조서렬측정,병진행료기인조결구여공능주석분석.A1501기인조산장4 567 418 bp,함유4 146개ORFs.해기인조중이감정료42개편마전좌매적중복서렬,저사서렬적존재예시착전좌현상재A1501균중비상활약,예시해균여기타생물지간기인교류가능비교빈번.비교기인조표명,위료괄응특정적생존배경,가단포균재기인조결구화유전신식용량상산생료명현적분화.차외,기인조분석감정료A1501배경괄응적유전기출,포괄물질전운、신호전도화추화계통등,저사계통시세균능구재근제토양배경중보지경쟁력이급능구여수도형성고효연합고담체계적관건.A1501기인조적완성위진일보개전공능기인조학화단백질조학연구전정료기출.
