暨南大学学报（自然科学与医学版）
暨南大學學報（自然科學與醫學版）
기남대학학보（자연과학여의학판）
JOURNAL OF JINAN UNIVERSITY（NATURAL SCIENCE & MEDICINE EDITION）
2006年
3期
476-482
,共7页
谢春芳%黄辉%姚冬生%刘大岭%梁郁强
謝春芳%黃輝%姚鼕生%劉大嶺%樑鬱彊
사춘방%황휘%요동생%류대령%량욱강
假密环菌%阿拉伯糖苷酶%生物信息学
假密環菌%阿拉伯糖苷酶%生物信息學
가밀배균%아랍백당감매%생물신식학
通过对假密环菌(Armillariella tabescens)的表达cDNA克隆文库进行随机测序,获得一段与多形拟杆菌的阿拉伯糖苷酶序列同源性很高的EST序列(AJ620046).根据获得的EST序列用SMART-RACE技术成功从假密环菌中克隆出了阿拉伯糖苷酶基因的全长cDNA,用生物信息学的方法对所获的序列进行信息学分析.分析结果显示其全长cDNA为1 016 bp,其最长的开放阅读框架为924 bp,编码307个氨基酸,该全长cDNA序列与多形拟杆菌的阿拉伯糖苷酶序列具有较高同源性,80～279位氨基酸序列属于阿拉伯糖苷酶超家族,58～184位氨基酸是一个典型的结构功能域,蛋白分子质量预测为32 881 u,等电点为4.59.构建重组质粒pPIC9-AF,并在毕赤酵母菌GS115中对所获得的基因进行了表达,相对酶活达到了81.25%.
通過對假密環菌(Armillariella tabescens)的錶達cDNA剋隆文庫進行隨機測序,穫得一段與多形擬桿菌的阿拉伯糖苷酶序列同源性很高的EST序列(AJ620046).根據穫得的EST序列用SMART-RACE技術成功從假密環菌中剋隆齣瞭阿拉伯糖苷酶基因的全長cDNA,用生物信息學的方法對所穫的序列進行信息學分析.分析結果顯示其全長cDNA為1 016 bp,其最長的開放閱讀框架為924 bp,編碼307箇氨基痠,該全長cDNA序列與多形擬桿菌的阿拉伯糖苷酶序列具有較高同源性,80～279位氨基痠序列屬于阿拉伯糖苷酶超傢族,58～184位氨基痠是一箇典型的結構功能域,蛋白分子質量預測為32 881 u,等電點為4.59.構建重組質粒pPIC9-AF,併在畢赤酵母菌GS115中對所穫得的基因進行瞭錶達,相對酶活達到瞭81.25%.
통과대가밀배균(Armillariella tabescens)적표체cDNA극륭문고진행수궤측서,획득일단여다형의간균적아랍백당감매서렬동원성흔고적EST서렬(AJ620046).근거획득적EST서렬용SMART-RACE기술성공종가밀배균중극륭출료아랍백당감매기인적전장cDNA,용생물신식학적방법대소획적서렬진행신식학분석.분석결과현시기전장cDNA위1 016 bp,기최장적개방열독광가위924 bp,편마307개안기산,해전장cDNA서렬여다형의간균적아랍백당감매서렬구유교고동원성,80～279위안기산서렬속우아랍백당감매초가족,58～184위안기산시일개전형적결구공능역,단백분자질량예측위32 881 u,등전점위4.59.구건중조질립pPIC9-AF,병재필적효모균GS115중대소획득적기인진행료표체,상대매활체도료81.25%.
