动物医学进展
動物醫學進展
동물의학진전
PROGRESS IN VETERINARY MEDICINE
2010年
8期
45-50
,共6页
陈进喜%施开创%屈素洁%郑敏%李向涛%陈宏备%许瑞胜
陳進喜%施開創%屈素潔%鄭敏%李嚮濤%陳宏備%許瑞勝
진진희%시개창%굴소길%정민%리향도%진굉비%허서성
猪%脑心肌炎病毒%VP1基因%分子特征
豬%腦心肌炎病毒%VP1基因%分子特徵
저%뇌심기염병독%VP1기인%분자특정
应用RT-PCR方法扩增猪脑心肌炎病毒GXLC株的VP1基因,扩增产物克隆入pMD 18-T载体后进行测序,对获得的VP1基因序列进行分析.序列分析表明,GXLC株VP1基因长度为831 bp,编码277 aa,含有2个潜在的N-糖基化基序和9个抗原表位.同源性分析表明,GXLC株与国内外其他26个EMCV分离株VP1基因核苷酸序列的同源性在78.6%～99.6%之间、氨基酸序列的同源性在95.1%～99.3%之间.遗传进化分析表明,基于VP1基因序列绘制的系统进化树可以将所有EMCV分离株分成两个群,即Ⅰ群和Ⅱ群,Ⅰ群可再细分为Ⅰa亚群和Ⅰb亚群,其中猪源、鼠源EMCV在Ⅰ群和Ⅱ群中均有分布,人源EMCV则分布在Ⅱ群;GXLC株与其他中国分离株均属于Ⅰa亚群.
應用RT-PCR方法擴增豬腦心肌炎病毒GXLC株的VP1基因,擴增產物剋隆入pMD 18-T載體後進行測序,對穫得的VP1基因序列進行分析.序列分析錶明,GXLC株VP1基因長度為831 bp,編碼277 aa,含有2箇潛在的N-糖基化基序和9箇抗原錶位.同源性分析錶明,GXLC株與國內外其他26箇EMCV分離株VP1基因覈苷痠序列的同源性在78.6%～99.6%之間、氨基痠序列的同源性在95.1%～99.3%之間.遺傳進化分析錶明,基于VP1基因序列繪製的繫統進化樹可以將所有EMCV分離株分成兩箇群,即Ⅰ群和Ⅱ群,Ⅰ群可再細分為Ⅰa亞群和Ⅰb亞群,其中豬源、鼠源EMCV在Ⅰ群和Ⅱ群中均有分佈,人源EMCV則分佈在Ⅱ群;GXLC株與其他中國分離株均屬于Ⅰa亞群.
응용RT-PCR방법확증저뇌심기염병독GXLC주적VP1기인,확증산물극륭입pMD 18-T재체후진행측서,대획득적VP1기인서렬진행분석.서렬분석표명,GXLC주VP1기인장도위831 bp,편마277 aa,함유2개잠재적N-당기화기서화9개항원표위.동원성분석표명,GXLC주여국내외기타26개EMCV분리주VP1기인핵감산서렬적동원성재78.6%～99.6%지간、안기산서렬적동원성재95.1%～99.3%지간.유전진화분석표명,기우VP1기인서렬회제적계통진화수가이장소유EMCV분리주분성량개군,즉Ⅰ군화Ⅱ군,Ⅰ군가재세분위Ⅰa아군화Ⅰb아군,기중저원、서원EMCV재Ⅰ군화Ⅱ군중균유분포,인원EMCV칙분포재Ⅱ군;GXLC주여기타중국분리주균속우Ⅰa아군.
