中国肺癌杂志
中國肺癌雜誌
중국폐암잡지
CHINESE JOURNAL OF LUNG CANCER
2012年
9期
521-530
,共10页
周丹菲%程西安%杨拴盈%明宗娟%李维%张秋红%张玉萍
週丹菲%程西安%楊拴盈%明宗娟%李維%張鞦紅%張玉萍
주단비%정서안%양전영%명종연%리유%장추홍%장옥평
鸟氨酸氨基转移酶%肺肿瘤%表达%生物信息学
鳥氨痠氨基轉移酶%肺腫瘤%錶達%生物信息學
조안산안기전이매%폐종류%표체%생물신식학
背景与目的 已有的研究表明,鸟氨酸氨基转移酶( ornithine aminotransferase,OAT)可能参与多种恶性肿瘤的发生和发展,本研究旨在检测非小细胞肺癌( non-small cell lung cancer,NSCLC) 中OAT mRNA和蛋白质的表达,并对其进行生物信息学分析.方法 通过RT-PCR的方法比较A549和16HBE细胞间OAT mRNA水平的差异;采用免疫组织化学SP法检测55例肺癌组织和17例癌旁肺组织中OAT蛋白表达;利用生物信息学的方法对OAT蛋白的生物信息学特征和相互作用蛋白进行分析,并对筛选出来的相互作用蛋白进行GO注释和信号通路分析.结果 ①A549中OAT mRNA相对含量较16HBE中低,两者差异约2.85倍.②NSCLC中OAT蛋白的表达明显高于癌旁肺组织(P＜0.05);OAT蛋白在鳞癌和腺癌间的表达差异有统计学意义,而与患者性别、年龄、有无淋巴结转移、肿瘤直径及TNM分期无关.③生物信息学分析提示OAT蛋白定位于线粒体、为高度保守的亲水性蛋白,具有Aminotran-3结构域,可能存在多个丝/苏氨酸磷酸化位点,在信号转导、转录和分子转运等方面发挥一定的作用;在筛选出来的54种可能和OAT存在相互作用的蛋白质中,TNF和TRAF6这两种蛋白参与了NF-κB信号通路.结论 OAT可能在NSCLC的发生和发展中发挥重要作用,有望成为肺癌的早期诊断标志物和治疗的新靶点.
揹景與目的 已有的研究錶明,鳥氨痠氨基轉移酶( ornithine aminotransferase,OAT)可能參與多種噁性腫瘤的髮生和髮展,本研究旨在檢測非小細胞肺癌( non-small cell lung cancer,NSCLC) 中OAT mRNA和蛋白質的錶達,併對其進行生物信息學分析.方法 通過RT-PCR的方法比較A549和16HBE細胞間OAT mRNA水平的差異;採用免疫組織化學SP法檢測55例肺癌組織和17例癌徬肺組織中OAT蛋白錶達;利用生物信息學的方法對OAT蛋白的生物信息學特徵和相互作用蛋白進行分析,併對篩選齣來的相互作用蛋白進行GO註釋和信號通路分析.結果 ①A549中OAT mRNA相對含量較16HBE中低,兩者差異約2.85倍.②NSCLC中OAT蛋白的錶達明顯高于癌徬肺組織(P＜0.05);OAT蛋白在鱗癌和腺癌間的錶達差異有統計學意義,而與患者性彆、年齡、有無淋巴結轉移、腫瘤直徑及TNM分期無關.③生物信息學分析提示OAT蛋白定位于線粒體、為高度保守的親水性蛋白,具有Aminotran-3結構域,可能存在多箇絲/囌氨痠燐痠化位點,在信號轉導、轉錄和分子轉運等方麵髮揮一定的作用;在篩選齣來的54種可能和OAT存在相互作用的蛋白質中,TNF和TRAF6這兩種蛋白參與瞭NF-κB信號通路.結論 OAT可能在NSCLC的髮生和髮展中髮揮重要作用,有望成為肺癌的早期診斷標誌物和治療的新靶點.
배경여목적 이유적연구표명,조안산안기전이매( ornithine aminotransferase,OAT)가능삼여다충악성종류적발생화발전,본연구지재검측비소세포폐암( non-small cell lung cancer,NSCLC) 중OAT mRNA화단백질적표체,병대기진행생물신식학분석.방법 통과RT-PCR적방법비교A549화16HBE세포간OAT mRNA수평적차이;채용면역조직화학SP법검측55례폐암조직화17례암방폐조직중OAT단백표체;이용생물신식학적방법대OAT단백적생물신식학특정화상호작용단백진행분석,병대사선출래적상호작용단백진행GO주석화신호통로분석.결과 ①A549중OAT mRNA상대함량교16HBE중저,량자차이약2.85배.②NSCLC중OAT단백적표체명현고우암방폐조직(P＜0.05);OAT단백재린암화선암간적표체차이유통계학의의,이여환자성별、년령、유무림파결전이、종류직경급TNM분기무관.③생물신식학분석제시OAT단백정위우선립체、위고도보수적친수성단백,구유Aminotran-3결구역,가능존재다개사/소안산린산화위점,재신호전도、전록화분자전운등방면발휘일정적작용;재사선출래적54충가능화OAT존재상호작용적단백질중,TNF화TRAF6저량충단백삼여료NF-κB신호통로.결론 OAT가능재NSCLC적발생화발전중발휘중요작용,유망성위폐암적조기진단표지물화치료적신파점.
