华南农业大学学报
華南農業大學學報
화남농업대학학보
JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY
2009年
4期
19-23
,共5页
甘蔗杆状病毒%杂种甘蔗%病毒同源序列%序列分析
甘蔗桿狀病毒%雜種甘蔗%病毒同源序列%序列分析
감자간상병독%잡충감자%병독동원서렬%서렬분석
为研究甘蔗杆状病毒Sugarcane bacilliform virus(SCBV)的基因组片段是否整合进杂种甘蔗Saccharum inter-specific hybrids基因组,以采自广西甘蔗研究所的1株杂种甘蔗植株叶片总DNA为模板,根据已报道的甘蔗杆状病毒基因组序列设计多条特异引物.经PCR扩增、产物克隆及序列分析,获得1个全长为5 364 bp的核苷酸序列.该序列具有SCBV基因组结构特征,含有2个完整的ORF,与GenBank中已报道的2个SCBV分离物之间的核苷酸及氨基酸序列同一性均大于70%,但该序列与完整的SCBV基因组全序列相比,不具备完全的ORF3,缺失了对病毒复制过程极为重要的功能性基因RNase H的序列区段.通过Southern-blot杂交分析,初步推测其为一段整合入杂种甘蔗基因组中的SCBV基因组序列.
為研究甘蔗桿狀病毒Sugarcane bacilliform virus(SCBV)的基因組片段是否整閤進雜種甘蔗Saccharum inter-specific hybrids基因組,以採自廣西甘蔗研究所的1株雜種甘蔗植株葉片總DNA為模闆,根據已報道的甘蔗桿狀病毒基因組序列設計多條特異引物.經PCR擴增、產物剋隆及序列分析,穫得1箇全長為5 364 bp的覈苷痠序列.該序列具有SCBV基因組結構特徵,含有2箇完整的ORF,與GenBank中已報道的2箇SCBV分離物之間的覈苷痠及氨基痠序列同一性均大于70%,但該序列與完整的SCBV基因組全序列相比,不具備完全的ORF3,缺失瞭對病毒複製過程極為重要的功能性基因RNase H的序列區段.通過Southern-blot雜交分析,初步推測其為一段整閤入雜種甘蔗基因組中的SCBV基因組序列.
위연구감자간상병독Sugarcane bacilliform virus(SCBV)적기인조편단시부정합진잡충감자Saccharum inter-specific hybrids기인조,이채자엄서감자연구소적1주잡충감자식주협편총DNA위모판,근거이보도적감자간상병독기인조서렬설계다조특이인물.경PCR확증、산물극륭급서렬분석,획득1개전장위5 364 bp적핵감산서렬.해서렬구유SCBV기인조결구특정,함유2개완정적ORF,여GenBank중이보도적2개SCBV분리물지간적핵감산급안기산서렬동일성균대우70%,단해서렬여완정적SCBV기인조전서렬상비,불구비완전적ORF3,결실료대병독복제과정겁위중요적공능성기인RNase H적서렬구단.통과Southern-blot잡교분석,초보추측기위일단정합입잡충감자기인조중적SCBV기인조서렬.
