中山大学学报（自然科学版）
中山大學學報（自然科學版）
중산대학학보（자연과학판）
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2009年
5期
120-124,130
,共6页
南方红豆杉%紫杉烷7β-羟基化酶基因%正选择%负选择
南方紅豆杉%紫杉烷7β-羥基化酶基因%正選擇%負選擇
남방홍두삼%자삼완7β-간기화매기인%정선택%부선택
从南方红豆杉Taxus wallichiana var.mairei的新鲜嫩叶中提取基因组DNA作为模板,利用三组特异引物进行PCR扩增,然后克隆测序得到紫杉烷7β-羟基化酶的基因全长.该基因编码区起始密码子为ATG,终止密码子为TGA,全长1 692 bp;碱基组成为490 A (29.0%),351 C (20.7%),362 G (21.4%)和489 T (28.9%).将紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列与细胞色素P450基因家族的其它三个成员进行比对,发现它与紫杉烷2α-羟基化酶基因、紫杉烷10β-羟基化酶基因及紫杉烷13α-羟基化酶基因的一致性分别为74%、68%及76%.它们的外显子和内含子的连接区均具保守的GT-AG结构,内含子区的变异性明显高于外显子区.进一步以红豆杉属的13个紫杉烷羟基化酶基因家族成员为对象,利用位点间可变ω(非同义替换率dN和同义替换率dS的比值) 模型对该基因家族的适应性进化进行分析.分支模型、位点模型以及分支-位点模型的分析表明:紫杉烷羟基化酶基因家族的少数分支处于正选择压力下(ω>1),但未检测到正选择位点;而绝大部分位点受强烈的负选择作用(ω<1).
從南方紅豆杉Taxus wallichiana var.mairei的新鮮嫩葉中提取基因組DNA作為模闆,利用三組特異引物進行PCR擴增,然後剋隆測序得到紫杉烷7β-羥基化酶的基因全長.該基因編碼區起始密碼子為ATG,終止密碼子為TGA,全長1 692 bp;堿基組成為490 A (29.0%),351 C (20.7%),362 G (21.4%)和489 T (28.9%).將紫杉烷7β-羥基化酶基因全長序列與細胞色素P450基因傢族的其它三箇成員進行比對,髮現它與紫杉烷2α-羥基化酶基因、紫杉烷10β-羥基化酶基因及紫杉烷13α-羥基化酶基因的一緻性分彆為74%、68%及76%.它們的外顯子和內含子的連接區均具保守的GT-AG結構,內含子區的變異性明顯高于外顯子區.進一步以紅豆杉屬的13箇紫杉烷羥基化酶基因傢族成員為對象,利用位點間可變ω(非同義替換率dN和同義替換率dS的比值) 模型對該基因傢族的適應性進化進行分析.分支模型、位點模型以及分支-位點模型的分析錶明:紫杉烷羥基化酶基因傢族的少數分支處于正選擇壓力下(ω>1),但未檢測到正選擇位點;而絕大部分位點受彊烈的負選擇作用(ω<1).
종남방홍두삼Taxus wallichiana var.mairei적신선눈협중제취기인조DNA작위모판,이용삼조특이인물진행PCR확증,연후극륭측서득도자삼완7β-간기화매적기인전장.해기인편마구기시밀마자위ATG,종지밀마자위TGA,전장1 692 bp;감기조성위490 A (29.0%),351 C (20.7%),362 G (21.4%)화489 T (28.9%).장자삼완7β-간기화매기인전장서렬여세포색소P450기인가족적기타삼개성원진행비대,발현타여자삼완2α-간기화매기인、자삼완10β-간기화매기인급자삼완13α-간기화매기인적일치성분별위74%、68%급76%.타문적외현자화내함자적련접구균구보수적GT-AG결구,내함자구적변이성명현고우외현자구.진일보이홍두삼속적13개자삼완간기화매기인가족성원위대상,이용위점간가변ω(비동의체환솔dN화동의체환솔dS적비치) 모형대해기인가족적괄응성진화진행분석.분지모형、위점모형이급분지-위점모형적분석표명:자삼완간기화매기인가족적소수분지처우정선택압력하(ω>1),단미검측도정선택위점;이절대부분위점수강렬적부선택작용(ω<1).
