CAJ | 학술논문

采用同源序列法对6个芥菜型油菜(Brassica juncea)品种(高芥酸、中芥酸、低芥酸)、2份白菜型油菜品种(高芥酸和低芥酸)和 1 份黑芥品种的FAE1基因进行克隆和测序表明,9个品种的FAE1基因编码区全长均为1 522 bp,不含内含子,均编码507个氨基酸残基.序列比较表明,芥菜型油菜中有两种FAE1基因序列(BjFAE1.1和BjFAE1.2),其亲缘种白菜型油菜和黑芥中各有一种FAE1基因序列(BrFAE1和BnFAE1),BjFAE1.1对应于白菜型油菜的BrFAE1,BjFAE1.2对应于黑芥的BnFAE1;BjFAE1.1和BjFAE1.2之间存在71 bp处核苷酸变异和Hind Ⅲ不同的酶切位点(第1415位和第1144位),蛋白质水平上存在15处氨基酸变异.比较不同芥酸含量品种的FAE1基因序列表明,BjFAE1.1基因存在2个SNP位点(第968位和第1265位),BjFAE1.2基因也有2个SNP位点(第49位和第237位),这4个SNP位点中有3个位点(第49位、第968位和第1265位)导致蛋白质水平上氨基酸的差异.其中BjFAE1.1基因第968位的碱基变化(C→T)引起的第323位氨基酸变化(Thr→Ile),能够解释芥菜型油菜和白菜型油菜高芥酸到低芥酸(中芥酸)的转变;第1265位的碱基变化(T→C)引起的第422位的氨基酸变化(Phe→Ser),能够部分解释芥菜型油菜的高芥酸到低芥酸(中芥酸)的转变,白菜型油菜的高芥酸和低芥酸品种在该位点的碱基没有变化.BjFAE1.2基因第49位的碱基变化(T→C)引起的第17位氨基酸的变化(Phe→Leu),可以解释芥菜型油菜的中芥酸变成高芥酸(低芥酸).陕北黄芥低芥酸突变株1278→3的FAE1基因序列和国外低芥酸品种比较,只在第1265位出现变异.
채용동원서렬법대6개개채형유채(Brassica juncea)품충(고개산、중개산、저개산)、2빈백채형유채품충(고개산화저개산)화 1 빈흑개품충적FAE1기인진행극륭화측서표명,9개품충적FAE1기인편마구전장균위1 522 bp,불함내함자,균편마507개안기산잔기.서렬비교표명,개채형유채중유량충FAE1기인서렬(BjFAE1.1화BjFAE1.2),기친연충백채형유채화흑개중각유일충FAE1기인서렬(BrFAE1화BnFAE1),BjFAE1.1대응우백채형유채적BrFAE1,BjFAE1.2대응우흑개적BnFAE1;BjFAE1.1화BjFAE1.2지간존재71 bp처핵감산변이화Hind Ⅲ불동적매절위점(제1415위화제1144위),단백질수평상존재15처안기산변이.비교불동개산함량품충적FAE1기인서렬표명,BjFAE1.1기인존재2개SNP위점(제968위화제1265위),BjFAE1.2기인야유2개SNP위점(제49위화제237위),저4개SNP위점중유3개위점(제49위、제968위화제1265위)도치단백질수평상안기산적차이.기중BjFAE1.1기인제968위적감기변화(C→T)인기적제323위안기산변화(Thr→Ile),능구해석개채형유채화백채형유채고개산도저개산(중개산)적전변;제1265위적감기변화(T→C)인기적제422위적안기산변화(Phe→Ser),능구부분해석개채형유채적고개산도저개산(중개산)적전변,백채형유채적고개산화저개산품충재해위점적감기몰유변화.BjFAE1.2기인제49위적감기변화(T→C)인기적제17위안기산적변화(Phe→Leu),가이해석개채형유채적중개산변성고개산(저개산).협북황개저개산돌변주1278→3적FAE1기인서렬화국외저개산품충비교,지재제1265위출현변이.