CAJ | 학술논문

采用组合的信号肽分析软件SignalP 3.0,TMHMM 2.0,big-PI,TargetP 1.1和Lipop 1.0对已公布的522个草鱼ORF编码蛋白的N端氨基酸序列进行信号肽分析,同时系统分析了信号肽的类型及结构.结果表明,522个草鱼氨基酸序列中分泌蛋白有61个,占其基因组编码蛋白的11.7%.编码这些蛋白的可读框(ORF)最小值为127 bp,最大值为5032 bp,平均910 bp,引导它们的信号肽长度介于15～32个氨基酸之间,平均为21个氨基酸.通过对草鱼分泌蛋白切割位点信号肽类型分析发现具Ⅰ型信号肽的分泌蛋白有17个,Ⅱ型的有4个.草鱼分泌蛋白中,42个具可预测功能,19个为未知功能蛋白.已知功能的分泌蛋白主要集中于细胞代谢,细胞调控及转运,细胞膜结构,细胞的免疫等领域.
채용조합적신호태분석연건SignalP 3.0,TMHMM 2.0,big-PI,TargetP 1.1화Lipop 1.0대이공포적522개초어ORF편마단백적N단안기산서렬진행신호태분석,동시계통분석료신호태적류형급결구.결과표명,522개초어안기산서렬중분비단백유61개,점기기인조편마단백적11.7%.편마저사단백적가독광(ORF)최소치위127 bp,최대치위5032 bp,평균910 bp,인도타문적신호태장도개우15～32개안기산지간,평균위21개안기산.통과대초어분비단백절할위점신호태류형분석발현구Ⅰ형신호태적분비단백유17개,Ⅱ형적유4개.초어분비단백중,42개구가예측공능,19개위미지공능단백.이지공능적분비단백주요집중우세포대사,세포조공급전운,세포막결구,세포적면역등영역.