高技术通讯
高技術通訊
고기술통신
HIGH TECHNOLOGY LETTERS
2008年
9期
985-990
,共6页
叶旭红%茅云翔%莫照兰%郝彬%邹玉霞%李杰
葉旭紅%茅雲翔%莫照蘭%郝彬%鄒玉霞%李傑
협욱홍%모운상%막조란%학빈%추옥하%리걸
鳗弧菌%aroA基因%生物信息学分析
鰻弧菌%aroA基因%生物信息學分析
만호균%aroA기인%생물신식학분석
为克隆鳗弧菌aroA基因 (它在细菌中编码合成芳香族氨基酸的关键酶--5-烯醇氏丙酮酰莽草酸3-磷酸(EPSP)合成酶),在实验室中构建了鳗弧菌M3大分子量基因组Fosmid文库,并通过克隆测序获得了部分序列,以此为基础,通过延伸测序获得了ar oA基因序列全长. 该基因全长1281bp,编码427个氨基酸,包含一个11个氨基酸残基的信号肽;编码区GC平均含量为46.8%,推测分子量为46177 Da.相似性分析表明,鳗弧菌的aroA核苷酸和氨基酸序列与其他弧菌的相似性最高,分别在73%～75%和78%～82%;进化树结果也表明鳗弧菌ar oA与其他弧菌的亲缘关系最近.aroA基因的克隆为构建鳗弧菌弱毒疫苗奠定了基础.
為剋隆鰻弧菌aroA基因 (它在細菌中編碼閤成芳香族氨基痠的關鍵酶--5-烯醇氏丙酮酰莽草痠3-燐痠(EPSP)閤成酶),在實驗室中構建瞭鰻弧菌M3大分子量基因組Fosmid文庫,併通過剋隆測序穫得瞭部分序列,以此為基礎,通過延伸測序穫得瞭ar oA基因序列全長. 該基因全長1281bp,編碼427箇氨基痠,包含一箇11箇氨基痠殘基的信號肽;編碼區GC平均含量為46.8%,推測分子量為46177 Da.相似性分析錶明,鰻弧菌的aroA覈苷痠和氨基痠序列與其他弧菌的相似性最高,分彆在73%～75%和78%～82%;進化樹結果也錶明鰻弧菌ar oA與其他弧菌的親緣關繫最近.aroA基因的剋隆為構建鰻弧菌弱毒疫苗奠定瞭基礎.
위극륭만호균aroA기인 (타재세균중편마합성방향족안기산적관건매--5-희순씨병동선망초산3-린산(EPSP)합성매),재실험실중구건료만호균M3대분자량기인조Fosmid문고,병통과극륭측서획득료부분서렬,이차위기출,통과연신측서획득료ar oA기인서렬전장. 해기인전장1281bp,편마427개안기산,포함일개11개안기산잔기적신호태;편마구GC평균함량위46.8%,추측분자량위46177 Da.상사성분석표명,만호균적aroA핵감산화안기산서렬여기타호균적상사성최고,분별재73%～75%화78%～82%;진화수결과야표명만호균ar oA여기타호균적친연관계최근.aroA기인적극륭위구건만호균약독역묘전정료기출.
