计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2010年
9期
1201-1204
,共4页
中药化学成分%机器学习方法%靶点识别
中藥化學成分%機器學習方法%靶點識彆
중약화학성분%궤기학습방법%파점식별
与有效成分相作用靶点的识别是从分子水平阐明中药作用机理的关键步骤.本文提出1种新的思路来解决中药化学成分的靶点识别问题.该方法基于小分子化合物的结构,计算表征分子组成、电荷分布、拓扑、几何结构及物理化学性质的分子描述符,经BestFirst搜索策略和CfsSubsetEval评估策略相结合的方法筛选出与靶点作用活性相关的分子描述符.采用径向基神经网络、朴素贝叶斯和随机森林3种机器学习方法构建一系列靶点的识别模型,后期将所建模型整合成靶点识别系统,进而预测中药有效成分的作用靶点.采用10折交叉验证,3种方法得到总的预测正确率分别为83.33%~95.71%、84.62%~96.43%、82.14%~95.59%,识别过程在(0.02~0.19)秒完成.实验结果证明该方法不但简单有效,更主要的是满足面向中药化学成分的靶点识别任务对辨识效率的要求.
與有效成分相作用靶點的識彆是從分子水平闡明中藥作用機理的關鍵步驟.本文提齣1種新的思路來解決中藥化學成分的靶點識彆問題.該方法基于小分子化閤物的結構,計算錶徵分子組成、電荷分佈、拓撲、幾何結構及物理化學性質的分子描述符,經BestFirst搜索策略和CfsSubsetEval評估策略相結閤的方法篩選齣與靶點作用活性相關的分子描述符.採用徑嚮基神經網絡、樸素貝葉斯和隨機森林3種機器學習方法構建一繫列靶點的識彆模型,後期將所建模型整閤成靶點識彆繫統,進而預測中藥有效成分的作用靶點.採用10摺交扠驗證,3種方法得到總的預測正確率分彆為83.33%~95.71%、84.62%~96.43%、82.14%~95.59%,識彆過程在(0.02~0.19)秒完成.實驗結果證明該方法不但簡單有效,更主要的是滿足麵嚮中藥化學成分的靶點識彆任務對辨識效率的要求.
여유효성분상작용파점적식별시종분자수평천명중약작용궤리적관건보취.본문제출1충신적사로래해결중약화학성분적파점식별문제.해방법기우소분자화합물적결구,계산표정분자조성、전하분포、탁복、궤하결구급물이화학성질적분자묘술부,경BestFirst수색책략화CfsSubsetEval평고책략상결합적방법사선출여파점작용활성상관적분자묘술부.채용경향기신경망락、박소패협사화수궤삼림3충궤기학습방법구건일계렬파점적식별모형,후기장소건모형정합성파점식별계통,진이예측중약유효성분적작용파점.채용10절교차험증,3충방법득도총적예측정학솔분별위83.33%~95.71%、84.62%~96.43%、82.14%~95.59%,식별과정재(0.02~0.19)초완성.실험결과증명해방법불단간단유효,경주요적시만족면향중약화학성분적파점식별임무대변식효솔적요구.