遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2012年
4期
485-494
,共10页
游录鹏%苗婧%邹爱兰%戚金亮%杨永华
遊錄鵬%苗婧%鄒愛蘭%慼金亮%楊永華
유록붕%묘청%추애란%척금량%양영화
马铃薯晚疫病%Rpi-blb2%LRR区域%多态性
馬鈴藷晚疫病%Rpi-blb2%LRR區域%多態性
마령서만역병%Rpi-blb2%LRR구역%다태성
马铃薯抗晚疫病基因Rpi-blb2 是来源于马铃薯野生种Solanum bulbocastanum 中的一个具有广谱抗性的NBS-LRR 类抗病基因.文章用PCR 的方法从20 个高抗晚疫病的马铃薯栽培种和20 个高感晚疫病的马铃薯栽培种以及7 个马铃薯野生种中克隆了Rpi-blb2 基因的 LRR 区段.采用生物信息学方法对这些序列的相似性、多态性位点、核酸多样性指数等参数进行了分析,发现Rpi-blb2 的LRR 区域在核酸水平上变异程度很高,而且存在多处热点突变位点;通过对该区域的Ka/Ks 值进行估算,发现Rpi-blb2 的LRR 区域总体上受到纯化选择,功能保守,但是LRR 区域的不同部位所受到的选择压力却不尽相同.同时,从核酸水平来看,Rpi-blb2 基因的LRR 区域在马铃薯栽培种和马铃薯野生种之间没有发现明显的分化.
馬鈴藷抗晚疫病基因Rpi-blb2 是來源于馬鈴藷野生種Solanum bulbocastanum 中的一箇具有廣譜抗性的NBS-LRR 類抗病基因.文章用PCR 的方法從20 箇高抗晚疫病的馬鈴藷栽培種和20 箇高感晚疫病的馬鈴藷栽培種以及7 箇馬鈴藷野生種中剋隆瞭Rpi-blb2 基因的 LRR 區段.採用生物信息學方法對這些序列的相似性、多態性位點、覈痠多樣性指數等參數進行瞭分析,髮現Rpi-blb2 的LRR 區域在覈痠水平上變異程度很高,而且存在多處熱點突變位點;通過對該區域的Ka/Ks 值進行估算,髮現Rpi-blb2 的LRR 區域總體上受到純化選擇,功能保守,但是LRR 區域的不同部位所受到的選擇壓力卻不儘相同.同時,從覈痠水平來看,Rpi-blb2 基因的LRR 區域在馬鈴藷栽培種和馬鈴藷野生種之間沒有髮現明顯的分化.
마령서항만역병기인Rpi-blb2 시래원우마령서야생충Solanum bulbocastanum 중적일개구유엄보항성적NBS-LRR 류항병기인.문장용PCR 적방법종20 개고항만역병적마령서재배충화20 개고감만역병적마령서재배충이급7 개마령서야생충중극륭료Rpi-blb2 기인적 LRR 구단.채용생물신식학방법대저사서렬적상사성、다태성위점、핵산다양성지수등삼수진행료분석,발현Rpi-blb2 적LRR 구역재핵산수평상변이정도흔고,이차존재다처열점돌변위점;통과대해구역적Ka/Ks 치진행고산,발현Rpi-blb2 적LRR 구역총체상수도순화선택,공능보수,단시LRR 구역적불동부위소수도적선택압력각불진상동.동시,종핵산수평래간,Rpi-blb2 기인적LRR 구역재마령서재배충화마령서야생충지간몰유발현명현적분화.
