CAJ | 학술논문

采用Affymetrix 60 K水稻基因表达芯片系统分析了水稻培矮64S(Oryza sativa ssp.indica)在低温、高温和干旱条件下不同生育时期的叶片与穗全基因组的转录丰度,筛选出一个类糖基转移酶基因OsCrGtl(Oryza sativacold responsive glycosyltransferase-like gene,GenBank登录号为FJ828672),该基因主要受低温诱导且在各生育时期的表达量均显著上调.用实时定量RT-PCR方法对该基因的在逆境条件下的转录丰度进行了验证分析,也得到与基因芯片分析基本相同的结果.以培矮64S mRNA为模板,通过RT-PCR方法扩增,得到包含其完整开放阅读框的cDNA克隆.根据其开放阅读框的核苷酸序列推测,OsCrGtl编码一个包含462个氨基酸残基的蛋白质,理论分子量为50.327kD,等电点为5.35.查询蛋白质数据库,得知该基因编码的蛋白质与籼稻(indica)、粳稻(japonica)、玉米(Zea mays)及拟南芥(Arabidopsis thaliana)编码的糖基转移酶家族蛋白相似,且包含糖基转移酶结构域.对其推测的启动子区域核苷酸序列进行分析,找到9个可能与逆境应答有关的顺式作用元件.
채용Affymetrix 60 K수도기인표체심편계통분석료수도배왜64S(Oryza sativa ssp.indica)재저온、고온화간한조건하불동생육시기적협편여수전기인조적전록봉도,사선출일개류당기전이매기인OsCrGtl(Oryza sativacold responsive glycosyltransferase-like gene,GenBank등록호위FJ828672),해기인주요수저온유도차재각생육시기적표체량균현저상조.용실시정량RT-PCR방법대해기인적재역경조건하적전록봉도진행료험증분석,야득도여기인심편분석기본상동적결과.이배왜64S mRNA위모판,통과RT-PCR방법확증,득도포함기완정개방열독광적cDNA극륭.근거기개방열독광적핵감산서렬추측,OsCrGtl편마일개포함462개안기산잔기적단백질,이론분자량위50.327kD,등전점위5.35.사순단백질수거고,득지해기인편마적단백질여선도(indica)、갱도(japonica)、옥미(Zea mays)급의남개(Arabidopsis thaliana)편마적당기전이매가족단백상사,차포함당기전이매결구역.대기추측적계동자구역핵감산서렬진행분석,조도9개가능여역경응답유관적순식작용원건.