CAJ | 학술논문

草鱼呼肠孤病毒HZ08株是本实验室从患出血病草鱼体内分离到的一个新毒株,已完成部分基因序列的分析,其氨基酸序列的同源性和873株相比,仅为20%~30%之间.因序列差异较大,无法通过设计特异性引物来扩增和分析其基因序列,采用单引物扩增技术,对HZ08株S4基因进行序列分析表明:S4全长为2263 bp,最大的ORF编码717个氨基酸,推导出其表达的蛋白约为79 kDa.正如其他基因节段,基因末端也含有保守碱基序列5′(GUAAUUU…UUCAUC),3′.S4基因推导的氨基酸序列与同宿主的其他呼肠孤病毒的非结构蛋白NS1同源性最大,其次是和哺乳动物正呼肠孤病毒的非结构蛋白mu-NS以及禽呼肠孤病毒非结构蛋白NS1同源性较大,表明S4可能表达细胞骨架相关蛋白.基于S4推导出的氨基酸序列构建的系统进化树HZ08株单独作为一个分支,与同宿主的其他呼肠孤病毒亲缘关系比较近,而与其他呼肠孤病毒则相对较远.这提示HZ08株可能是多个毒株的遗传信息经长期的遗传进化而得,综合其它已知序列信息,推测HZ08株可能为呼肠孤病毒的一个新成员.
초어호장고병독HZ08주시본실험실종환출혈병초어체내분리도적일개신독주,이완성부분기인서렬적분석,기안기산서렬적동원성화873주상비,부위20%~30%지간.인서렬차이교대,무법통과설계특이성인물래확증화분석기기인서렬,채용단인물확증기술,대HZ08주S4기인진행서렬분석표명:S4전장위2263 bp,최대적ORF편마717개안기산,추도출기표체적단백약위79 kDa.정여기타기인절단,기인말단야함유보수감기서렬5′(GUAAUUU…UUCAUC),3′.S4기인추도적안기산서렬여동숙주적기타호장고병독적비결구단백NS1동원성최대,기차시화포유동물정호장고병독적비결구단백mu-NS이급금호장고병독비결구단백NS1동원성교대,표명S4가능표체세포골가상관단백.기우S4추도출적안기산서렬구건적계통진화수HZ08주단독작위일개분지,여동숙주적기타호장고병독친연관계비교근,이여기타호장고병독칙상대교원.저제시HZ08주가능시다개독주적유전신식경장기적유전진화이득,종합기타이지서렬신식,추측HZ08주가능위호장고병독적일개신성원.