激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2008年
3期
311-316
,共6页
屠振力%吕霄%姚邦%王家刚%林蓉
屠振力%呂霄%姚邦%王傢剛%林蓉
도진력%려소%요방%왕가강%림용
抗辐射菌%质粒pUE30%序列测定%同源性分析
抗輻射菌%質粒pUE30%序列測定%同源性分析
항복사균%질립pUE30%서렬측정%동원성분석
抗辐射菌(Deinococcus radiopugnance) ATCC 19172株中存在约14.6 kb、8.7 kb、7.0 kb、3.65 kb、及2.45 kb等5种以上的隐秘性质粒,对其中的约2.45 kb的小型质粒pUE30进行了序列测定与分析,该质粒由2 467 bp的碱基对组成,其中包含了267 nt及1 068 nt的2个开放阅读框架(open reading frame,ORF)和一个AT-rich领域.经过与GenBank的数据库分析,其中267 nt的ORF(repC)与豆科根瘤菌(Rhizobium leguminosa-rum)及根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)由来的质粒的RepC蛋白质具有一定的同源性;1 068 nt的ORF(repD)与抗辐射菌(Deinococcus radiodurans)Sark株的质粒pUE10的RepU蛋白质、嗜热菌(Thermus sp.)ATCC27737株由来的质粒pMY1的RepA蛋白质具有较高的同源性.研究结果对于利用该小型质粒构建大肠杆菌-抗辐射菌属间的穿梭载体,表明抗辐射菌高效正确的DNA损伤修复机理等具有重要的意义.
抗輻射菌(Deinococcus radiopugnance) ATCC 19172株中存在約14.6 kb、8.7 kb、7.0 kb、3.65 kb、及2.45 kb等5種以上的隱祕性質粒,對其中的約2.45 kb的小型質粒pUE30進行瞭序列測定與分析,該質粒由2 467 bp的堿基對組成,其中包含瞭267 nt及1 068 nt的2箇開放閱讀框架(open reading frame,ORF)和一箇AT-rich領域.經過與GenBank的數據庫分析,其中267 nt的ORF(repC)與豆科根瘤菌(Rhizobium leguminosa-rum)及根癌農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)由來的質粒的RepC蛋白質具有一定的同源性;1 068 nt的ORF(repD)與抗輻射菌(Deinococcus radiodurans)Sark株的質粒pUE10的RepU蛋白質、嗜熱菌(Thermus sp.)ATCC27737株由來的質粒pMY1的RepA蛋白質具有較高的同源性.研究結果對于利用該小型質粒構建大腸桿菌-抗輻射菌屬間的穿梭載體,錶明抗輻射菌高效正確的DNA損傷脩複機理等具有重要的意義.
항복사균(Deinococcus radiopugnance) ATCC 19172주중존재약14.6 kb、8.7 kb、7.0 kb、3.65 kb、급2.45 kb등5충이상적은비성질립,대기중적약2.45 kb적소형질립pUE30진행료서렬측정여분석,해질립유2 467 bp적감기대조성,기중포함료267 nt급1 068 nt적2개개방열독광가(open reading frame,ORF)화일개AT-rich영역.경과여GenBank적수거고분석,기중267 nt적ORF(repC)여두과근류균(Rhizobium leguminosa-rum)급근암농간균(Agrobacterium tumefaciens)유래적질립적RepC단백질구유일정적동원성;1 068 nt적ORF(repD)여항복사균(Deinococcus radiodurans)Sark주적질립pUE10적RepU단백질、기열균(Thermus sp.)ATCC27737주유래적질립pMY1적RepA단백질구유교고적동원성.연구결과대우이용해소형질립구건대장간균-항복사균속간적천사재체,표명항복사균고효정학적DNA손상수복궤리등구유중요적의의.
