生物技术通讯
生物技術通訊
생물기술통신
LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
2010年
2期
227-231
,共5页
李玩生%房永祥%曾爽%景志忠
李玩生%房永祥%曾爽%景誌忠
리완생%방영상%증상%경지충
猪T细胞受体γ链%基因克隆%生物信患学%结构预测
豬T細胞受體γ鏈%基因剋隆%生物信患學%結構預測
저T세포수체γ련%기인극륭%생물신환학%결구예측
目的:克隆猪T细胞受体γ链(pTCR-γ)基因,用以研究猪T细胞受体分子结构与功能.方法与结果:以GenBank上登载的pTCR-γ基因为参考序列,用RT-PCR法从猪外周血淋巴细胞中克隆pTCR-γ基因.序列分析表明,pTCR-γ基因开放读框为1026 bp,编码341个氨基酸残基,合有由23个氨基酸残基构成的信号肽序列;与参考序列相比,在核苷酸和推导氨基酸序列上的同源性分别为95.6%和88.8%;系统进化分析发现,该基因与绵羊、恒河猴、人、马、牛的同源性相对较高,与褐鼠、家犬、家鼠、家猫的同源性次之,而与禽类、鱼类的同源性最低;生物信息学结构预测表明猪T细胞受体γ链含2个结构域,其中1个为IG_LIKE1结构域(IGv结构域),由第14~114位共101个氨基酸残基组成;另一个为IG_LIKE2结构域(IGc结构域),由第143~238位共96个氨基酸残基组成.结论:克隆并应用生物信息学技术分析了猪T细胞受体γ链基因序列及编码蛋白的结构特征,为进一步研究γ链的结构与功能奠定了基础.
目的:剋隆豬T細胞受體γ鏈(pTCR-γ)基因,用以研究豬T細胞受體分子結構與功能.方法與結果:以GenBank上登載的pTCR-γ基因為參攷序列,用RT-PCR法從豬外週血淋巴細胞中剋隆pTCR-γ基因.序列分析錶明,pTCR-γ基因開放讀框為1026 bp,編碼341箇氨基痠殘基,閤有由23箇氨基痠殘基構成的信號肽序列;與參攷序列相比,在覈苷痠和推導氨基痠序列上的同源性分彆為95.6%和88.8%;繫統進化分析髮現,該基因與綿羊、恆河猴、人、馬、牛的同源性相對較高,與褐鼠、傢犬、傢鼠、傢貓的同源性次之,而與禽類、魚類的同源性最低;生物信息學結構預測錶明豬T細胞受體γ鏈含2箇結構域,其中1箇為IG_LIKE1結構域(IGv結構域),由第14~114位共101箇氨基痠殘基組成;另一箇為IG_LIKE2結構域(IGc結構域),由第143~238位共96箇氨基痠殘基組成.結論:剋隆併應用生物信息學技術分析瞭豬T細胞受體γ鏈基因序列及編碼蛋白的結構特徵,為進一步研究γ鏈的結構與功能奠定瞭基礎.
목적:극륭저T세포수체γ련(pTCR-γ)기인,용이연구저T세포수체분자결구여공능.방법여결과:이GenBank상등재적pTCR-γ기인위삼고서렬,용RT-PCR법종저외주혈림파세포중극륭pTCR-γ기인.서렬분석표명,pTCR-γ기인개방독광위1026 bp,편마341개안기산잔기,합유유23개안기산잔기구성적신호태서렬;여삼고서렬상비,재핵감산화추도안기산서렬상적동원성분별위95.6%화88.8%;계통진화분석발현,해기인여면양、항하후、인、마、우적동원성상대교고,여갈서、가견、가서、가묘적동원성차지,이여금류、어류적동원성최저;생물신식학결구예측표명저T세포수체γ련함2개결구역,기중1개위IG_LIKE1결구역(IGv결구역),유제14~114위공101개안기산잔기조성;령일개위IG_LIKE2결구역(IGc결구역),유제143~238위공96개안기산잔기조성.결론:극륭병응용생물신식학기술분석료저T세포수체γ련기인서렬급편마단백적결구특정,위진일보연구γ련적결구여공능전정료기출.