中国预防兽医学报
中國預防獸醫學報
중국예방수의학보
CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE
2012年
3期
180-183
,共4页
刘孝珍%陈建飞%时洪艳%张鑫%石达%刘胜旺%冯力
劉孝珍%陳建飛%時洪豔%張鑫%石達%劉勝旺%馮力
류효진%진건비%시홍염%장흠%석체%류성왕%풍력
猪流行性腹泻病毒%遗传变异%S1基因
豬流行性腹瀉病毒%遺傳變異%S1基因
저류행성복사병독%유전변이%S1기인
为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定；并将其进行比对和遗传演化分析.结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病毒株S1基因核苷酸序列同源性为90.54 ％～99.96％,与经典病毒株CV777相比,其中有6个S1基因在453 bp～454 bp处存在3个核苷酸的缺失；一个在453 bp～454 bp处缺失6个核苷酸；其它10个S1基因在173 bp～186 bp之间存在12个核苷酸的插入,413 bp～417 bp之间有3个核苷酸的插入,467 bp～468 bp处缺失6个核苷酸,插入和缺失位点与韩国病毒株KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801相似.S1基因系统进化树分析表明,PEDV S1基因分为3群,其中7个S1基因属于PEDV Ⅰ群,另外10个属于PEDV Ⅲ群.
為分析豬流行性腹瀉病毒(PEDV)的遺傳變異情況,本研究設計閤成2對擴增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,對2011年分離的17箇PEDV S1基因進行擴增、剋隆和序列測定；併將其進行比對和遺傳縯化分析.結果錶明:17箇PEDV S1基因序列與參攷病毒株S1基因覈苷痠序列同源性為90.54 ％～99.96％,與經典病毒株CV777相比,其中有6箇S1基因在453 bp～454 bp處存在3箇覈苷痠的缺失；一箇在453 bp～454 bp處缺失6箇覈苷痠；其它10箇S1基因在173 bp～186 bp之間存在12箇覈苷痠的插入,413 bp～417 bp之間有3箇覈苷痠的插入,467 bp～468 bp處缺失6箇覈苷痠,插入和缺失位點與韓國病毒株KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801相似.S1基因繫統進化樹分析錶明,PEDV S1基因分為3群,其中7箇S1基因屬于PEDV Ⅰ群,另外10箇屬于PEDV Ⅲ群.
위분석저류행성복사병독(PEDV)적유전변이정황,본연구설계합성2대확증S1기인적인물,이용투식RT-PCR방법,대2011년분리적17개PEDV S1기인진행확증、극륭화서렬측정；병장기진행비대화유전연화분석.결과표명:17개PEDV S1기인서렬여삼고병독주S1기인핵감산서렬동원성위90.54 ％～99.96％,여경전병독주CV777상비,기중유6개S1기인재453 bp～454 bp처존재3개핵감산적결실；일개재453 bp～454 bp처결실6개핵감산；기타10개S1기인재173 bp～186 bp지간존재12개핵감산적삽입,413 bp～417 bp지간유3개핵감산적삽입,467 bp～468 bp처결실6개핵감산,삽입화결실위점여한국병독주KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801상사.S1기인계통진화수분석표명,PEDV S1기인분위3군,기중7개S1기인속우PEDV Ⅰ군,령외10개속우PEDV Ⅲ군.
