CAJ | 학술논문

首先通过基因组DNA的提取、通用引物PCR扩增和长PCR扩增,从而获得日本鼓虾(Alpheus japonicus)的线粒体DNA；应用鸟枪法和引物步移法测序,获得了日本鼓虾的线粒体基因组全序列.结合GenBank线粒体基因组数据库中鲜明鼓虾(A.distinguendus)的线粒体基因组,比较分析了鼓虾线粒体基因组的基本特征、基因排列、蛋白质编码基因、选择压力和差异位点等.研究结果表明,在日本鼓虾线粒体基因组中共存在9对基因的重叠.日本鼓虾线粒体基因组全长16 487 bp,较鲜明鼓虾线粒体基因组(15 700 bp)长,主要是由于最大非编码区的长度存在差异.日本鼓虾与鲜明鼓虾线粒体基因组均编码37个基因,且37个基因的基因排列完全一致；与泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列相比,仅出现1个转运RNA基因(trnE)的易位和倒位.2个鼓虾线粒体基因组蛋白质编码基因的起始密码子和终止密码子存在差异.除了cob基因外,其余12个蛋白质编码基因所编码氨基酸的数目均完全相同.鼓虾线粒体基因组13个线粒体蛋白质编码基因的Ka/Ks比值都远远低于1,显示出较强的负选择.在15个主编码基因中,nad5基因的变异位点数最多,其次是nad4基因和lrRNA基因.因此,nad5,nad4和lrRNA基因可以作为备选的分子标记,用于分析鼓虾不同物种和群体之间的生物多样性.
수선통과기인조DNA적제취、통용인물PCR확증화장PCR확증,종이획득일본고하(Alpheus japonicus)적선립체DNA；응용조창법화인물보이법측서,획득료일본고하적선립체기인조전서렬.결합GenBank선립체기인조수거고중선명고하(A.distinguendus)적선립체기인조,비교분석료고하선립체기인조적기본특정、기인배렬、단백질편마기인、선택압력화차이위점등.연구결과표명,재일본고하선립체기인조중공존재9대기인적중첩.일본고하선립체기인조전장16 487 bp,교선명고하선립체기인조(15 700 bp)장,주요시유우최대비편마구적장도존재차이.일본고하여선명고하선립체기인조균편마37개기인,차37개기인적기인배렬완전일치；여범갑각동물선립체기인조적원시배렬상비,부출현1개전운RNA기인(trnE)적역위화도위.2개고하선립체기인조단백질편마기인적기시밀마자화종지밀마자존재차이.제료cob기인외,기여12개단백질편마기인소편마안기산적수목균완전상동.고하선립체기인조13개선립체단백질편마기인적Ka/Ks비치도원원저우1,현시출교강적부선택.재15개주편마기인중,nad5기인적변이위점수최다,기차시nad4기인화lrRNA기인.인차,nad5,nad4화lrRNA기인가이작위비선적분자표기,용우분석고하불동물충화군체지간적생물다양성.