生物物理学报
生物物理學報
생물물이학보
ACTA BIOPHYSICA SINICA
2005年
4期
277-283
,共7页
转录调控%协同增效作用%寡核苷酸对%内含子%酵母基因
轉錄調控%協同增效作用%寡覈苷痠對%內含子%酵母基因
전록조공%협동증효작용%과핵감산대%내함자%효모기인
根据实验观察到的DNA成环和弯折机制,以140bp为分界点,探讨高频转录基因上游区与内含子之间可能存在的短程和长程转录协同增效作用(synergy).用与随机序列做对比的方法,抽提出最近距离在140bp以下的寡核苷酸对,以及最近距离在140bp以上的寡核苷酸对.仔细分析两种距离下的可能的协同寡核苷酸对的位置特征和碱基组分,发现短程协同作用的寡核苷酸对的平均最近距离都在110bp以下,位于上游区的CCAA是一个很明显的特征;而长程协同作用的寡核苷酸对的平均最近距离集中在250～400bp,并且在多数寡核苷酸对中,位于上游区的寡核苷酸是GC丰富的正调控元件.
根據實驗觀察到的DNA成環和彎摺機製,以140bp為分界點,探討高頻轉錄基因上遊區與內含子之間可能存在的短程和長程轉錄協同增效作用(synergy).用與隨機序列做對比的方法,抽提齣最近距離在140bp以下的寡覈苷痠對,以及最近距離在140bp以上的寡覈苷痠對.仔細分析兩種距離下的可能的協同寡覈苷痠對的位置特徵和堿基組分,髮現短程協同作用的寡覈苷痠對的平均最近距離都在110bp以下,位于上遊區的CCAA是一箇很明顯的特徵;而長程協同作用的寡覈苷痠對的平均最近距離集中在250～400bp,併且在多數寡覈苷痠對中,位于上遊區的寡覈苷痠是GC豐富的正調控元件.
근거실험관찰도적DNA성배화만절궤제,이140bp위분계점,탐토고빈전록기인상유구여내함자지간가능존재적단정화장정전록협동증효작용(synergy).용여수궤서렬주대비적방법,추제출최근거리재140bp이하적과핵감산대,이급최근거리재140bp이상적과핵감산대.자세분석량충거리하적가능적협동과핵감산대적위치특정화감기조분,발현단정협동작용적과핵감산대적평균최근거리도재110bp이하,위우상유구적CCAA시일개흔명현적특정;이장정협동작용적과핵감산대적평균최근거리집중재250～400bp,병차재다수과핵감산대중,위우상유구적과핵감산시GC봉부적정조공원건.
