中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2011年
6期
148-154
,共7页
蒋巧巧%龙桂友%李武文%邓子牛
蔣巧巧%龍桂友%李武文%鄧子牛
장교교%룡계우%리무문%산자우
甜橙%SCoT%均匀设计%序列比对
甜橙%SCoT%均勻設計%序列比對
첨등%SCoT%균균설계%서렬비대
本试验对SCoT应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异;结果表明,甜橙SCoT标记的20μL优化反应体系为:DNA模板80 ng,Mg2+浓度1.6 mmol/L,dNTPs浓度0.3 mmol/L,引物浓度0.2μml/L,Taq DNA聚合酶用量1.6 U,扩增产物在100~2000 bp之间,扩增条带明亮清晰,反应体系具有良好的稳定性和可重复性.24份试材的测序片段的大小为1090-1091 bp,一致性达到99.84%,存在单碱基的缺失与替换,BLAST结果显示.该序列的编码蛋白质与核糖体蛋白S3的N端同源性高;利用单碱基变异可以区分其中的12个甜橙变异株系和'安江香柚',其他变异株系还需要结合其他的分子标记技术来进行鉴别,有待进一步研究.
本試驗對SCoT應體繫進行優化,併篩選閤適的引物,然後對24份試材進行SCoT標記,穫得的目的片段剋隆測序,通過測序結果探討其遺傳變異;結果錶明,甜橙SCoT標記的20μL優化反應體繫為:DNA模闆80 ng,Mg2+濃度1.6 mmol/L,dNTPs濃度0.3 mmol/L,引物濃度0.2μml/L,Taq DNA聚閤酶用量1.6 U,擴增產物在100~2000 bp之間,擴增條帶明亮清晰,反應體繫具有良好的穩定性和可重複性.24份試材的測序片段的大小為1090-1091 bp,一緻性達到99.84%,存在單堿基的缺失與替換,BLAST結果顯示.該序列的編碼蛋白質與覈糖體蛋白S3的N耑同源性高;利用單堿基變異可以區分其中的12箇甜橙變異株繫和'安江香柚',其他變異株繫還需要結閤其他的分子標記技術來進行鑒彆,有待進一步研究.
본시험대SCoT응체계진행우화,병사선합괄적인물,연후대24빈시재진행SCoT표기,획득적목적편단극륭측서,통과측서결과탐토기유전변이;결과표명,첨등SCoT표기적20μL우화반응체계위:DNA모판80 ng,Mg2+농도1.6 mmol/L,dNTPs농도0.3 mmol/L,인물농도0.2μml/L,Taq DNA취합매용량1.6 U,확증산물재100~2000 bp지간,확증조대명량청석,반응체계구유량호적은정성화가중복성.24빈시재적측서편단적대소위1090-1091 bp,일치성체도99.84%,존재단감기적결실여체환,BLAST결과현시.해서렬적편마단백질여핵당체단백S3적N단동원성고;이용단감기변이가이구분기중적12개첨등변이주계화'안강향유',기타변이주계환수요결합기타적분자표기기술래진행감별,유대진일보연구.