计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2012年
14期
203-207,234
,共6页
支持向量机%番茄%miRNA%预测
支持嚮量機%番茄%miRNA%預測
지지향량궤%번가%miRNA%예측
为了识别番茄基因组中潜在的miRNA,基于已发现的miRNA特征,利用支持向量机方法构建模型sly_pre_SVM和sly_SVM,用于番茄的前体miRNA序列和成熟miRNA序列的预测.对miRNA特征向量的编码、miRNA特征选择和参数的优化进行了研究.sly_pre_SVM对番茄测试集的分类精度、敏感性和特异性分别为99.69％、100％和99.66％,sly_SVM对番茄测试集的分类精度、敏感性和特异性分别为89.79％、88.89％和90％.预测得到41条番茄成熟miRNA序列,其中14条是尚未发现的,为进一步的miRNA生物学实验奠定了基础.
為瞭識彆番茄基因組中潛在的miRNA,基于已髮現的miRNA特徵,利用支持嚮量機方法構建模型sly_pre_SVM和sly_SVM,用于番茄的前體miRNA序列和成熟miRNA序列的預測.對miRNA特徵嚮量的編碼、miRNA特徵選擇和參數的優化進行瞭研究.sly_pre_SVM對番茄測試集的分類精度、敏感性和特異性分彆為99.69％、100％和99.66％,sly_SVM對番茄測試集的分類精度、敏感性和特異性分彆為89.79％、88.89％和90％.預測得到41條番茄成熟miRNA序列,其中14條是尚未髮現的,為進一步的miRNA生物學實驗奠定瞭基礎.
위료식별번가기인조중잠재적miRNA,기우이발현적miRNA특정,이용지지향량궤방법구건모형sly_pre_SVM화sly_SVM,용우번가적전체miRNA서렬화성숙miRNA서렬적예측.대miRNA특정향량적편마、miRNA특정선택화삼수적우화진행료연구.sly_pre_SVM대번가측시집적분류정도、민감성화특이성분별위99.69％、100％화99.66％,sly_SVM대번가측시집적분류정도、민감성화특이성분별위89.79％、88.89％화90％.예측득도41조번가성숙miRNA서렬,기중14조시상미발현적,위진일보적miRNA생물학실험전정료기출.
