计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2008年
3期
265-268
,共4页
HMLP参数%肽%logP值%定量结构活性关系%支持向量机
HMLP參數%肽%logP值%定量結構活性關繫%支持嚮量機
HMLP삼수%태%logP치%정량결구활성관계%지지향량궤
肽的亲(疏)水性在生物活性肽的合理设计和药物发现中是非常重要的参数.基于表征氨基酸性质的HMLP参数,分别用直接替代法和加和替代法表征肽段的结构信息,采用留一法交叉检验,利用支持向量回归(SVR)构建了36个二肽辛醇-水分配系数(logP)的预测模型(ε=0.001,σ=7.5,C=200和ε=0.001,σ=10,C=200),结果表明加和替代法要好于直接替代法,且其留一法交叉检验的复相关系为0.8768,其预测结果与实验值一致.但二者都说明了logP主要与肽的分子表面积和亲水指标有关,同时说明HMLP参数能够较好地表征氨基酸或肽链的结构信息.
肽的親(疏)水性在生物活性肽的閤理設計和藥物髮現中是非常重要的參數.基于錶徵氨基痠性質的HMLP參數,分彆用直接替代法和加和替代法錶徵肽段的結構信息,採用留一法交扠檢驗,利用支持嚮量迴歸(SVR)構建瞭36箇二肽辛醇-水分配繫數(logP)的預測模型(ε=0.001,σ=7.5,C=200和ε=0.001,σ=10,C=200),結果錶明加和替代法要好于直接替代法,且其留一法交扠檢驗的複相關繫為0.8768,其預測結果與實驗值一緻.但二者都說明瞭logP主要與肽的分子錶麵積和親水指標有關,同時說明HMLP參數能夠較好地錶徵氨基痠或肽鏈的結構信息.
태적친(소)수성재생물활성태적합리설계화약물발현중시비상중요적삼수.기우표정안기산성질적HMLP삼수,분별용직접체대법화가화체대법표정태단적결구신식,채용류일법교차검험,이용지지향량회귀(SVR)구건료36개이태신순-수분배계수(logP)적예측모형(ε=0.001,σ=7.5,C=200화ε=0.001,σ=10,C=200),결과표명가화체대법요호우직접체대법,차기류일법교차검험적복상관계위0.8768,기예측결과여실험치일치.단이자도설명료logP주요여태적분자표면적화친수지표유관,동시설명HMLP삼수능구교호지표정안기산혹태련적결구신식.
