CAJ | 학술논문

目的:初步了解重症腹泻轮状病毒株NSP4基因特征及变异情况.方法:在2002年100例秋冬季腹泻患儿轮状病毒分子流行特征的研究中,确诊为轮状病毒腹泻的10例患儿的粪便标本,用PCR方法对其NSP4基因进行测定,并挑选出一株重症腹泻轮状病毒毒株(简称02'K1),采用一步法RT-PCR对其NSP4基因进行扩增获得NSP4 cDNA,利用银染测序方法对所扩增获得NSP4 cDNA进行测定.采用Winegene231核酸分析软件对02'K1株NSP4核苷酸序列进行翻译,同时利用Omiga生物软件对02'K1株、ST3株(人轮状病毒G4血清型)及代表NSP4四个主要基因型的之一的Wa株(简称Wa-1株)、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸序列进行比较,分析其同源性及02'K1株的NSP4氨基酸变异位点.结果:(1)经一步法RT-PCR扩增获得的NSP4 cDNA约725 bp,NSP4基因全长686个核苷酸,含有一个开放读码框架,编码一个由175个氨基酸组成的蛋白;(2)02'K1株与ST3株、Wa-1株、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸同源性均达90%以上;(3)与ST3比较,02'K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异,即aa16、aa26、aa60、aa72、aa76、aa124、aa135、aa140、aa141、aa 145、aa146、aa161、aa162、aa169.结论:(1)02'K1株的NSP4基因型属于Wa组;(2)02'K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异.
목적:초보료해중증복사륜상병독주NSP4기인특정급변이정황.방법:재2002년100례추동계복사환인륜상병독분자류행특정적연구중,학진위륜상병독복사적10례환인적분편표본,용PCR방법대기NSP4기인진행측정,병도선출일주중증복사륜상병독독주(간칭02'K1),채용일보법RT-PCR대기NSP4기인진행확증획득NSP4 cDNA,이용은염측서방법대소확증획득NSP4 cDNA진행측정.채용Winegene231핵산분석연건대02'K1주NSP4핵감산서렬진행번역,동시이용Omiga생물연건대02'K1주、ST3주(인륜상병독G4혈청형)급대표NSP4사개주요기인형적지일적Wa주(간칭Wa-1주)、Wa-a주、Wa-v주적핵감산화안기산서렬진행비교,분석기동원성급02'K1주적NSP4안기산변이위점.결과:(1)경일보법RT-PCR확증획득적NSP4 cDNA약725 bp,NSP4기인전장686개핵감산,함유일개개방독마광가,편마일개유175개안기산조성적단백;(2)02'K1주여ST3주、Wa-1주、Wa-a주、Wa-v주적핵감산화안기산동원성균체90%이상;(3)여ST3비교,02'K1주적NSP4안기산서렬유14개위점발생료변이,즉aa16、aa26、aa60、aa72、aa76、aa124、aa135、aa140、aa141、aa 145、aa146、aa161、aa162、aa169.결론:(1)02'K1주적NSP4기인형속우Wa조;(2)02'K1주적NSP4안기산서렬유14개위점발생료변이.