中华检验医学杂志
中華檢驗醫學雜誌
중화검험의학잡지
CHINESE JOURNAL OF LABORATORY MEDICINE
2011年
9期
849-854
,共6页
耿庆茂%李韩平%辛天义%庄道民%鲍作义%刘永健%李林%王铮%刘思扬%李敬云
耿慶茂%李韓平%辛天義%莊道民%鮑作義%劉永健%李林%王錚%劉思颺%李敬雲
경경무%리한평%신천의%장도민%포작의%류영건%리림%왕쟁%류사양%리경운
HIV-1%基因型%抗药性,病毒%微生物敏感性试验
HIV-1%基因型%抗藥性,病毒%微生物敏感性試驗
HIV-1%기인형%항약성,병독%미생물민감성시험
HIV-1%Genotype%Drug resistance,viral%Microbial sensitivity tests
目的 评价in-house HIV-1基因型耐药检测方法的敏感性与准确性。方法 收集2004年4月至2008年10月全军艾滋病检测中心检测的来自河南、广西130份血浆标本。以美国FDA批准的HIV-1基因型耐药性检测系统(ViroSeqTM v2.0)为参考方法，并与建立起的基因型耐药性检测方法(in-house)平行检测待检样本，比较二者在扩增效率、耐药突变位点检测以及耐药报告等方面的一致性。结果已知的14 850个耐药突变位点中,2种方法可同时对99.3％(14 752/14 850)的耐药突变位点准确检出；在对不同突变位点的检测中,2种方法对蛋白酶抑制剂耐药突变位点、逆转录酶抑制剂耐药突变位点及两类抑制剂耐药突变位点检测一致率分别为99.7％、99.0％和99.3％（Kappa值分别为0.909 9、0.952 1和0.948 8，P值均＜0.01）；2种方法出具的两类药物的耐药结果报告一致率94.6％（Kappa=0.637 4,P＜0.01）。本研究共检测到34个ViroSeqTM数据库(ViroSeqTM software v2.7)未收录位点，其中2个突变位点对耐药的影响较大。结论in-house基因型耐药性检测方法与ViroSeqTM基因型耐药性检测系统在耐药突变位点检测以及评价上具有高度一致性，是一种快速准确、性价比高的HIV-1基因型耐药检测方法，同时在耐药数据库方面具有一定优势。
目的 評價in-house HIV-1基因型耐藥檢測方法的敏感性與準確性。方法 收集2004年4月至2008年10月全軍艾滋病檢測中心檢測的來自河南、廣西130份血漿標本。以美國FDA批準的HIV-1基因型耐藥性檢測繫統(ViroSeqTM v2.0)為參攷方法，併與建立起的基因型耐藥性檢測方法(in-house)平行檢測待檢樣本，比較二者在擴增效率、耐藥突變位點檢測以及耐藥報告等方麵的一緻性。結果已知的14 850箇耐藥突變位點中,2種方法可同時對99.3％(14 752/14 850)的耐藥突變位點準確檢齣；在對不同突變位點的檢測中,2種方法對蛋白酶抑製劑耐藥突變位點、逆轉錄酶抑製劑耐藥突變位點及兩類抑製劑耐藥突變位點檢測一緻率分彆為99.7％、99.0％和99.3％（Kappa值分彆為0.909 9、0.952 1和0.948 8，P值均＜0.01）；2種方法齣具的兩類藥物的耐藥結果報告一緻率94.6％（Kappa=0.637 4,P＜0.01）。本研究共檢測到34箇ViroSeqTM數據庫(ViroSeqTM software v2.7)未收錄位點，其中2箇突變位點對耐藥的影響較大。結論in-house基因型耐藥性檢測方法與ViroSeqTM基因型耐藥性檢測繫統在耐藥突變位點檢測以及評價上具有高度一緻性，是一種快速準確、性價比高的HIV-1基因型耐藥檢測方法，同時在耐藥數據庫方麵具有一定優勢。
목적 평개in-house HIV-1기인형내약검측방법적민감성여준학성。방법 수집2004년4월지2008년10월전군애자병검측중심검측적래자하남、엄서130빈혈장표본。이미국FDA비준적HIV-1기인형내약성검측계통(ViroSeqTM v2.0)위삼고방법，병여건립기적기인형내약성검측방법(in-house)평행검측대검양본，비교이자재확증효솔、내약돌변위점검측이급내약보고등방면적일치성。결과이지적14 850개내약돌변위점중,2충방법가동시대99.3％(14 752/14 850)적내약돌변위점준학검출；재대불동돌변위점적검측중,2충방법대단백매억제제내약돌변위점、역전록매억제제내약돌변위점급량류억제제내약돌변위점검측일치솔분별위99.7％、99.0％화99.3％（Kappa치분별위0.909 9、0.952 1화0.948 8，P치균＜0.01）；2충방법출구적량류약물적내약결과보고일치솔94.6％（Kappa=0.637 4,P＜0.01）。본연구공검측도34개ViroSeqTM수거고(ViroSeqTM software v2.7)미수록위점，기중2개돌변위점대내약적영향교대。결론in-house기인형내약성검측방법여ViroSeqTM기인형내약성검측계통재내약돌변위점검측이급평개상구유고도일치성，시일충쾌속준학、성개비고적HIV-1기인형내약검측방법，동시재내약수거고방면구유일정우세。
Objective To evaluate the sensitivity and accuracy of an in-house detecting method of HIV-1 genotypic drug resistance system. Methods Totally 130 serum specimens from Henan and Guangxi province were collected from April 2004 to October 2008 and tested in the Military HIV Testing Center of China. ViroSeqTM v2.0 (Abbott, Switzerland), a US FDA approved HIV genotypic drug resistance detecting system was utilized as the reference method. All the specimens were detected by the novel in-house method and the reference method to validate the difference in amplifying efficiency, drug resistance mutation detection and drug resistance report. Results Concerning the 14 850 known drug resistance mutation sites,14 752 (99. 3％ ) mutations can be detected by both of the two methods. Rates of concordance of detection in the regions of protease inhibitors-, reverse transcriptase inhibitors- and both two classes inhibitors-resistance were99.7％ ( Kappa =0. 909 9 , P ＜0. 01 ) , 99. 0％ (Kappa=0.952 1, P＜0. 01) and99.3％ (Kappa=0. 948 8, P ＜ 0. 01 ) respectively. Drug resistance reports from these two systems showed similar results (Kappa = 0. 637 4, P ＜ 0. 01 ). The in-house detecting system identified 34 novel mutations besides the ViroSeqTM drug resistance mutation database ( ViroSeqTM software v2. 7). Two mutations, V179F and K238T,had significant effect on HIV drug resistance. Conclusions The in-house genotyping system is an accurate,cost-effective method and has a high concordance with commercial ViroSeqTM genotyping system. Database from the in-house assay was superior to this of the ViroSeqTM assay.
